畜牧与饲料科学
畜牧與飼料科學
축목여사료과학
ANIMAL HUSBANDRY AND FEED SCIENCE
2009年
10期
20-22
,共3页
白春艳%郭日东%关平原%乌日罕%特木尔巴根%马立峰%菊花
白春豔%郭日東%關平原%烏日罕%特木爾巴根%馬立峰%菊花
백춘염%곽일동%관평원%오일한%특목이파근%마립봉%국화
牛传染性鼻气管炎病毒%IBRV-NM06株%gE基因%克隆%序列分析
牛傳染性鼻氣管炎病毒%IBRV-NM06株%gE基因%剋隆%序列分析
우전염성비기관염병독%IBRV-NM06주%gE기인%극륭%서렬분석
参考GenBank发表的牛疱疹病毒Ⅰ型全基因序列设计gE基因PCR扩增引物,以牛传染性鼻气管炎病毒内蒙古分离株NM06提取的DNA为模板,运用PCR的方法扩增gE基因,扩增产物经克隆、序列测定和拼接,结果表明:测定序列全长为2086 bp,包含gE基因1793 bp,其中有1728 bp组成的完整开放阅读框,编码576个氨基酸.将NM06株gE基因序列与GenBank发表的参考毒株核苷酸序列相比,与4株BHV-1病毒的同源性在99.3%～99.9%;与2株BHV-1.1型分离株同源性高达99.5%、99.6%;与BHV-1.2型分离株同源性为93.4%.从进化树中也可以看出:NM06株与BHV-1.1型分离株属于同一个进化分支,而BHV-1.2 BH83株属于另一个进化分支,可以推测IBRV NM06分离株属于BHV-1.1型.NM06株与牛疱疹病毒5型N569病毒的同源性为82.9%,与鹿疱疹病毒2型Norway4病毒的同源性为72.6%.
參攷GenBank髮錶的牛皰疹病毒Ⅰ型全基因序列設計gE基因PCR擴增引物,以牛傳染性鼻氣管炎病毒內矇古分離株NM06提取的DNA為模闆,運用PCR的方法擴增gE基因,擴增產物經剋隆、序列測定和拼接,結果錶明:測定序列全長為2086 bp,包含gE基因1793 bp,其中有1728 bp組成的完整開放閱讀框,編碼576箇氨基痠.將NM06株gE基因序列與GenBank髮錶的參攷毒株覈苷痠序列相比,與4株BHV-1病毒的同源性在99.3%～99.9%;與2株BHV-1.1型分離株同源性高達99.5%、99.6%;與BHV-1.2型分離株同源性為93.4%.從進化樹中也可以看齣:NM06株與BHV-1.1型分離株屬于同一箇進化分支,而BHV-1.2 BH83株屬于另一箇進化分支,可以推測IBRV NM06分離株屬于BHV-1.1型.NM06株與牛皰疹病毒5型N569病毒的同源性為82.9%,與鹿皰疹病毒2型Norway4病毒的同源性為72.6%.
삼고GenBank발표적우포진병독Ⅰ형전기인서렬설계gE기인PCR확증인물,이우전염성비기관염병독내몽고분리주NM06제취적DNA위모판,운용PCR적방법확증gE기인,확증산물경극륭、서렬측정화병접,결과표명:측정서렬전장위2086 bp,포함gE기인1793 bp,기중유1728 bp조성적완정개방열독광,편마576개안기산.장NM06주gE기인서렬여GenBank발표적삼고독주핵감산서렬상비,여4주BHV-1병독적동원성재99.3%～99.9%;여2주BHV-1.1형분리주동원성고체99.5%、99.6%;여BHV-1.2형분리주동원성위93.4%.종진화수중야가이간출:NM06주여BHV-1.1형분리주속우동일개진화분지,이BHV-1.2 BH83주속우령일개진화분지,가이추측IBRV NM06분리주속우BHV-1.1형.NM06주여우포진병독5형N569병독적동원성위82.9%,여록포진병독2형Norway4병독적동원성위72.6%.
