物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2007年
2期
198-205
,共8页
宋哲%刘涛%刘伟%朱鸣华%王晓钢
宋哲%劉濤%劉偉%硃鳴華%王曉鋼
송철%류도%류위%주명화%왕효강
CTL表位%氨基酸结构描述符%定量构效关系%偏最小二乘法
CTL錶位%氨基痠結構描述符%定量構效關繫%偏最小二乘法
CTL표위%안기산결구묘술부%정량구효관계%편최소이승법
分别采用氨基酸序列及氨基酸结构描述符方法定量研究了短肽-MHC(major histocompatibility complex)分子结合亲合力的定量构效关系(QSAR)模型,用这两个模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度分别达到66.8%和65.5%.采用了去除"劣点"方法检验模型的鲁棒性,结果证明两个模型都具有良好的鲁棒性.通过改变两个模型的参数,对氨基酸残基个数为8或10的CTL(cytotoxicy Tlymphocyte)表位进行预测.
分彆採用氨基痠序列及氨基痠結構描述符方法定量研究瞭短肽-MHC(major histocompatibility complex)分子結閤親閤力的定量構效關繫(QSAR)模型,用這兩箇模型對短肽與HLA-A*0201分子結閤的805箇預測樣本進行瞭預測,預測準確度分彆達到66.8%和65.5%.採用瞭去除"劣點"方法檢驗模型的魯棒性,結果證明兩箇模型都具有良好的魯棒性.通過改變兩箇模型的參數,對氨基痠殘基箇數為8或10的CTL(cytotoxicy Tlymphocyte)錶位進行預測.
분별채용안기산서렬급안기산결구묘술부방법정량연구료단태-MHC(major histocompatibility complex)분자결합친합력적정량구효관계(QSAR)모형,용저량개모형대단태여HLA-A*0201분자결합적805개예측양본진행료예측,예측준학도분별체도66.8%화65.5%.채용료거제"렬점"방법검험모형적로봉성,결과증명량개모형도구유량호적로봉성.통과개변량개모형적삼수,대안기산잔기개수위8혹10적CTL(cytotoxicy Tlymphocyte)표위진행예측.
