CAJ | 학술논문

黏质沙雷氏菌(Serratia marcescens)可产生多种几丁质酶,为比较黏质沙雷氏菌Txch-1中几丁质酶系在结构上的差别,利用3对特异性引物从Txch-1中扩增获得了3种几丁质酶SeChiA、SeChiC、SeChi40基因,并进行生物信息学分析与比较.结果表明:SeChiA基因全长2196bp,含有1个1 692 bp的开放阅读框,编码563个氨基酸.SeChiA与Sanguibacter sp.C4几丁质酶(ABB91448)及多种沙雷氏菌属的几丁质酶A高度同源(≥94.8％),与多种昆虫几丁质酶也表现出较高的同源性(≥68.74％);结构域分析发现SeChiA含有分泌信号肽、N端结构域和催化域.SeChiC基因全长1 623 bp,含有1个1443 bp的开放阅读框,编码480个氨基酸;SeChiC与S.marcescens不同菌株产生的几丁质酶C都表现出较高的同源性(≥95％);结构域分析发现SeChiC含有催化域、黏蛋白Ⅲ同源区及几丁质结合域.SeChi40基因全长1 501 bp,含有1个1 083 bp的开放阅读框,编码360个氨基酸;结构域分析发现它只含有催化域,而不含分泌信号肽和几丁质结合域.氨基酸序列比对发现SeChi40与其他几丁质酶的同源性较低(≤37.78％),可能是个新基因.
점질사뢰씨균(Serratia marcescens)가산생다충궤정질매,위비교점질사뢰씨균Txch-1중궤정질매계재결구상적차별,이용3대특이성인물종Txch-1중확증획득료3충궤정질매SeChiA、SeChiC、SeChi40기인,병진행생물신식학분석여비교.결과표명:SeChiA기인전장2196bp,함유1개1 692 bp적개방열독광,편마563개안기산.SeChiA여Sanguibacter sp.C4궤정질매(ABB91448)급다충사뢰씨균속적궤정질매A고도동원(≥94.8％),여다충곤충궤정질매야표현출교고적동원성(≥68.74％);결구역분석발현SeChiA함유분비신호태、N단결구역화최화역.SeChiC기인전장1 623 bp,함유1개1443 bp적개방열독광,편마480개안기산;SeChiC여S.marcescens불동균주산생적궤정질매C도표현출교고적동원성(≥95％);결구역분석발현SeChiC함유최화역、점단백Ⅲ동원구급궤정질결합역.SeChi40기인전장1 501 bp,함유1개1 083 bp적개방열독광,편마360개안기산;결구역분석발현타지함유최화역,이불함분비신호태화궤정질결합역.안기산서렬비대발현SeChi40여기타궤정질매적동원성교저(≤37.78％),가능시개신기인.