浙江大学学报(农业与生命科学版)
浙江大學學報(農業與生命科學版)
절강대학학보(농업여생명과학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(AGRICULTURE & LIFE SCIENCES)
2012年
3期
271-278
,共8页
解小莉%梁丽萍%杜俊莉%袁志发
解小莉%樑麗萍%杜俊莉%袁誌髮
해소리%량려평%두준리%원지발
氨基酸序列%进化距离%动力学方程%估计
氨基痠序列%進化距離%動力學方程%估計
안기산서렬%진화거리%동역학방정%고계
在选择的思想下,建立了蛋白质氨基酸序列的进化动力学方程,提出了一个新的蛋白质氨基酸序列的进化距离——选择进化距离,该距离统一了前人提出的各种氨基酸序列的进化距离;将该动力学方程转换为线性模型后,利用最小二乘法可实现模型中参数b的估计;最后,通过17个物种的细胞色素b的氨基酸序列说明了该选择进化距离的计算方法,并根据自展法比较了不同进化距离得到的物种进化树.结果表明,利用选择进化距离构建的进化树与其他几种进化距离得到的进化树的拓扑结构一致,选择进化距离为估计蛋白质氨基酸序列的进化距离提供了新方法.
在選擇的思想下,建立瞭蛋白質氨基痠序列的進化動力學方程,提齣瞭一箇新的蛋白質氨基痠序列的進化距離——選擇進化距離,該距離統一瞭前人提齣的各種氨基痠序列的進化距離;將該動力學方程轉換為線性模型後,利用最小二乘法可實現模型中參數b的估計;最後,通過17箇物種的細胞色素b的氨基痠序列說明瞭該選擇進化距離的計算方法,併根據自展法比較瞭不同進化距離得到的物種進化樹.結果錶明,利用選擇進化距離構建的進化樹與其他幾種進化距離得到的進化樹的拓撲結構一緻,選擇進化距離為估計蛋白質氨基痠序列的進化距離提供瞭新方法.
재선택적사상하,건립료단백질안기산서렬적진화동역학방정,제출료일개신적단백질안기산서렬적진화거리——선택진화거리,해거리통일료전인제출적각충안기산서렬적진화거리;장해동역학방정전환위선성모형후,이용최소이승법가실현모형중삼수b적고계;최후,통과17개물충적세포색소b적안기산서렬설명료해선택진화거리적계산방법,병근거자전법비교료불동진화거리득도적물충진화수.결과표명,이용선택진화거리구건적진화수여기타궤충진화거리득도적진화수적탁복결구일치,선택진화거리위고계단백질안기산서렬적진화거리제공료신방법.