遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2012年
11期
1434-1446
,共13页
杨超%汪青雄%黄原%肖红
楊超%汪青雄%黃原%肖紅
양초%왕청웅%황원%초홍
棕头鸥%线粒体基因组%RNA二级结构%控制区结构
棕頭鷗%線粒體基因組%RNA二級結構%控製區結構
종두구%선립체기인조%RNA이급결구%공제구결구
基于长距PCR扩增及保守弓I物步移法测定并列.结果表明,棕头鸥线粒体基因组全长16 769 bp,GenBank登录号JX155863.基因含量和排列次序与红原鸡一致,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和一个D-loop区(控制区).除COI基因以GTG、ND3基因以ATT为起始密码子外,其余11个蛋白质编码基因均以ATG起始.11个蛋白质编码基因以典型的完全终止密码子AGG、TAG、TAA或AGA终止,COIII和ND4基因为不完全终止密码子T.预测了22个tRNA基因的二级结构,发现tRNASer(AGN)缺少DHU臂,tRNAPhe的TψC臂出现第4种排列形式.预测的棕头鸥12S和16S rRNA二级结构分别包括4个结构域47个茎环和6个结构域60个茎环.其他鸟类控制区发现的F-box、E-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB-boxes(1-3)也存在于棕头鸥中,预测了控制区H链复制起始序列OH和双向复制起始序列LSP/HSP.系统发育分析支持将棕头鸥划归为面具鸥族(Masked gulls).
基于長距PCR擴增及保守弓I物步移法測定併列.結果錶明,棕頭鷗線粒體基因組全長16 769 bp,GenBank登錄號JX155863.基因含量和排列次序與紅原鷄一緻,包含13箇蛋白編碼基因、22箇tRNA、2箇rRNA和一箇D-loop區(控製區).除COI基因以GTG、ND3基因以ATT為起始密碼子外,其餘11箇蛋白質編碼基因均以ATG起始.11箇蛋白質編碼基因以典型的完全終止密碼子AGG、TAG、TAA或AGA終止,COIII和ND4基因為不完全終止密碼子T.預測瞭22箇tRNA基因的二級結構,髮現tRNASer(AGN)缺少DHU臂,tRNAPhe的TψC臂齣現第4種排列形式.預測的棕頭鷗12S和16S rRNA二級結構分彆包括4箇結構域47箇莖環和6箇結構域60箇莖環.其他鳥類控製區髮現的F-box、E-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB-boxes(1-3)也存在于棕頭鷗中,預測瞭控製區H鏈複製起始序列OH和雙嚮複製起始序列LSP/HSP.繫統髮育分析支持將棕頭鷗劃歸為麵具鷗族(Masked gulls).
기우장거PCR확증급보수궁I물보이법측정병렬.결과표명,종두구선립체기인조전장16 769 bp,GenBank등록호JX155863.기인함량화배렬차서여홍원계일치,포함13개단백편마기인、22개tRNA、2개rRNA화일개D-loop구(공제구).제COI기인이GTG、ND3기인이ATT위기시밀마자외,기여11개단백질편마기인균이ATG기시.11개단백질편마기인이전형적완전종지밀마자AGG、TAG、TAA혹AGA종지,COIII화ND4기인위불완전종지밀마자T.예측료22개tRNA기인적이급결구,발현tRNASer(AGN)결소DHU비,tRNAPhe적TψC비출현제4충배렬형식.예측적종두구12S화16S rRNA이급결구분별포괄4개결구역47개경배화6개결구역60개경배.기타조류공제구발현적F-box、E-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box화CSB-boxes(1-3)야존재우종두구중,예측료공제구H련복제기시서렬OH화쌍향복제기시서렬LSP/HSP.계통발육분석지지장종두구화귀위면구구족(Masked gulls).
