CAJ | 학술논문

目的评估重复序列PCR (REP-PCR)技术在光滑假丝酵母菌基因分型中的作用.方法收集深部真菌感染患者体内分离的光滑假丝酵母菌34株,以API 20C AUX酵母菌鉴定板条鉴定菌种及生化表型.采用REP-PCR对34株光滑假丝酵母菌进行基因分型:提取真菌基因组DNA,以Care-2重复元件设计引物,PCR扩增产物电泳后运用NTSYS软件进行聚类分析,聚类树状图相似系数(SI)≥97％且无明显条带差异定为同一基因型,SI≥97％且仅相差一条条带定为亚型.比较REP-PCR分型与多位点序列分型(MLST)的辨别力指数(DP),分析具有不同生化表型光滑假丝酵母菌的REP-PCR基因分型情况.结果 REP-PCR基因分型结果显示:34株光滑假丝酵母菌分为17个基因型,其中A型8株,B型6株,C、D型各3株,E型2株,F～Q型各1株,未发现亚型.REP-PCR和MLST基因分型的DP (95％ CI)分别为0.911(0.770～0.980)和0.369(0.220～0.560),两者比较差异有统计学意义(x2 =21.68,P＜0.01).34株光滑假丝酵母菌有两种生化表型,生化表型代码分别为2000040(32株)和6000040(2株),生化表型代码为60000402的2株经REP-PCR分型结果分别为D型和K型(SI =0.43).结论 REP-PCR对光滑假丝酵母菌基因分型的辨别力较强且操作简便,适用于临床实验室对光滑假丝酵母菌的流行病学研究.
목적 평고중복서렬PCR (REP-PCR)기술재광활가사효모균기인분형중적작용.방법 수집심부진균감염환자체내분리적광활가사효모균34주,이API 20C AUX효모균감정판조감정균충급생화표형.채용REP-PCR대34주광활가사효모균진행기인분형:제취진균기인조DNA,이Care-2중복원건설계인물,PCR확증산물전영후운용NTSYS연건진행취류분석,취류수상도상사계수(SI)≥97％차무명현조대차이정위동일기인형,SI≥97％차부상차일조조대정위아형.비교REP-PCR분형여다위점서렬분형(MLST)적변별력지수(DP),분석구유불동생화표형광활가사효모균적REP-PCR기인분형정황.결과 REP-PCR기인분형결과현시:34주광활가사효모균분위17개기인형,기중A형8주,B형6주,C、D형각3주,E형2주,F～Q형각1주,미발현아형.REP-PCR화MLST기인분형적DP (95％ CI)분별위0.911(0.770～0.980)화0.369(0.220～0.560),량자비교차이유통계학의의(x2 =21.68,P＜0.01).34주광활가사효모균유량충생화표형,생화표형대마분별위2000040(32주)화6000040(2주),생화표형대마위60000402적2주경REP-PCR분형결과분별위D형화K형(SI =0.43).결론 REP-PCR대광활가사효모균기인분형적변별력교강차조작간편,괄용우림상실험실대광활가사효모균적류행병학연구.