安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2010年
34期
封2,封3
,共2页
王晓波%解天然%潘陈陈%华宿南
王曉波%解天然%潘陳陳%華宿南
왕효파%해천연%반진진%화숙남
大豆%生物信息学%大豆质膜内在水孔蛋白
大豆%生物信息學%大豆質膜內在水孔蛋白
대두%생물신식학%대두질막내재수공단백
[目的]利用生物信息学方法对大豆质膜内在水孔蛋白(GmPIP)的亚细胞定位、跨膜区、信号肽和磷酸化位点进行预测,为基因的功能研究提供参考.[方法]从干旱胁迫后的抗旱大豆品种晋豆21的叶片中克隆出GmPIP基因,利用PSLpred、Protcomp Version8.0、WoLF PSORT、CELLO v2.5等亚细胞预测工具进行亚细胞定位预测;利用TMHMM Server v. 2.0进行蛋白跨膜区分析;利用NetPhos2.0 Server进行磷酸化位点分析;利用SignalP 3.0 Server程序进行信号肽分析.[结果]综合4种工具的预测结果表明,GmPIP蛋白包含6个跨膜区,亚细胞定位预测表明该蛋白位于细胞质膜上,发现该蛋白的第254个氨基酸是一个潜在的糖基化位点和13个磷酸化位点,该蛋白没有明显的信号肽结构.[结论]利用不同方法进行的生物信息学分析结果可相互验证,生物信息学可以对未知蛋白进行初步的功能预测,有助于确定后续试验的方向.
[目的]利用生物信息學方法對大豆質膜內在水孔蛋白(GmPIP)的亞細胞定位、跨膜區、信號肽和燐痠化位點進行預測,為基因的功能研究提供參攷.[方法]從榦旱脅迫後的抗旱大豆品種晉豆21的葉片中剋隆齣GmPIP基因,利用PSLpred、Protcomp Version8.0、WoLF PSORT、CELLO v2.5等亞細胞預測工具進行亞細胞定位預測;利用TMHMM Server v. 2.0進行蛋白跨膜區分析;利用NetPhos2.0 Server進行燐痠化位點分析;利用SignalP 3.0 Server程序進行信號肽分析.[結果]綜閤4種工具的預測結果錶明,GmPIP蛋白包含6箇跨膜區,亞細胞定位預測錶明該蛋白位于細胞質膜上,髮現該蛋白的第254箇氨基痠是一箇潛在的糖基化位點和13箇燐痠化位點,該蛋白沒有明顯的信號肽結構.[結論]利用不同方法進行的生物信息學分析結果可相互驗證,生物信息學可以對未知蛋白進行初步的功能預測,有助于確定後續試驗的方嚮.
[목적]이용생물신식학방법대대두질막내재수공단백(GmPIP)적아세포정위、과막구、신호태화린산화위점진행예측,위기인적공능연구제공삼고.[방법]종간한협박후적항한대두품충진두21적협편중극륭출GmPIP기인,이용PSLpred、Protcomp Version8.0、WoLF PSORT、CELLO v2.5등아세포예측공구진행아세포정위예측;이용TMHMM Server v. 2.0진행단백과막구분석;이용NetPhos2.0 Server진행린산화위점분석;이용SignalP 3.0 Server정서진행신호태분석.[결과]종합4충공구적예측결과표명,GmPIP단백포함6개과막구,아세포정위예측표명해단백위우세포질막상,발현해단백적제254개안기산시일개잠재적당기화위점화13개린산화위점,해단백몰유명현적신호태결구.[결론]이용불동방법진행적생물신식학분석결과가상호험증,생물신식학가이대미지단백진행초보적공능예측,유조우학정후속시험적방향.
