作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2008年
12期
2085-2091
,共7页
余渝%王志伟%冯常辉%张艳欣%林忠旭%张献龙
餘渝%王誌偉%馮常輝%張豔訢%林忠旭%張獻龍
여투%왕지위%풍상휘%장염흔%림충욱%장헌룡
草棉%表达序列标签%简单序列重复%多态性信息含量%遗传作图
草棉%錶達序列標籤%簡單序列重複%多態性信息含量%遺傳作圖
초면%표체서렬표첨%간단서렬중복%다태성신식함량%유전작도
根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计.其中的25条序列含有27个SSR,1-6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高.为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST-SSR引物,其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带,产生92个多态性片段,平均每对引物产生3.64个多态性片段.引物的多态性信息含量(PIC)在0.49~0.91之间,平均为0.81.6对引物在BC1种间作图群体[(鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22]中表现多态性,产生7个多态性位点,其中5个为共显性,2个为显性.除HAU230b标记在BC1分离群体中不符合孟德尔式分离比例,其余引物表现正常分离.6个位点被整合到陆地棉和海岛棉种间BC1遗传连锁图谱卜的6条染色体:有4个位于A亚基因组的4条染色体上(Chr.6、10、11和12),2个位于D亚基因组的2条染色体(Chr.19和20).
根據GenBank中公佈的247條草棉EST序列,搜索SSR併進行引物設計.其中的25條序列含有27箇SSR,1-6堿基重複類型都存在,二堿基和三堿基重複的頻率較高.為瞭明確在A、D和AD基因組中的可轉移性,依據25條序列共設計25對EST-SSR引物,其中22對引物擴增齣清晰可辨的DNA條帶,產生92箇多態性片段,平均每對引物產生3.64箇多態性片段.引物的多態性信息含量(PIC)在0.49~0.91之間,平均為0.81.6對引物在BC1種間作圖群體[(鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22]中錶現多態性,產生7箇多態性位點,其中5箇為共顯性,2箇為顯性.除HAU230b標記在BC1分離群體中不符閤孟德爾式分離比例,其餘引物錶現正常分離.6箇位點被整閤到陸地棉和海島棉種間BC1遺傳連鎖圖譜蔔的6條染色體:有4箇位于A亞基因組的4條染色體上(Chr.6、10、11和12),2箇位于D亞基因組的2條染色體(Chr.19和20).
근거GenBank중공포적247조초면EST서렬,수색SSR병진행인물설계.기중적25조서렬함유27개SSR,1-6감기중복류형도존재,이감기화삼감기중복적빈솔교고.위료명학재A、D화AD기인조중적가전이성,의거25조서렬공설계25대EST-SSR인물,기중22대인물확증출청석가변적DNA조대,산생92개다태성편단,평균매대인물산생3.64개다태성편단.인물적다태성신식함량(PIC)재0.49~0.91지간,평균위0.81.6대인물재BC1충간작도군체[(악면22×Pima3-79)×악면22]중표현다태성,산생7개다태성위점,기중5개위공현성,2개위현성.제HAU230b표기재BC1분리군체중불부합맹덕이식분리비례,기여인물표현정상분리.6개위점피정합도륙지면화해도면충간BC1유전련쇄도보복적6조염색체:유4개위우A아기인조적4조염색체상(Chr.6、10、11화12),2개위우D아기인조적2조염색체(Chr.19화20).