病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2008年
1期
53-58
,共6页
孔义波%张兴晓%姜世金%赵钦%孙亚妮
孔義波%張興曉%薑世金%趙欽%孫亞妮
공의파%장흥효%강세금%조흠%손아니
内源性白血病病毒%全基因组核苷酸序列%同源性分析
內源性白血病病毒%全基因組覈苷痠序列%同源性分析
내원성백혈병병독%전기인조핵감산서렬%동원성분석
摘要:以国内某3家SPF鸡场的SPF鸡胚成纤维细胞提取的基因组DNA为模板,参照已发表的序列,设计合成了4对检测内源性白血病病毒引物,分别检测gag基因、pol基因、env基因和LTR片段,结果显示4者检出阳性率很高(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).设计合成了8对引物,选取4片段检测均为阳性的样品之一,经PCR成功扩增出了8段连续的、相互部分重叠的目的DNA片段,分别连接入T载体进行克隆测序.用DNAstar软件对测序结果进行拼接,从一个鸡胚得到了内源性白血病病毒前病毒全基因组序列.比较分析发现,该序列env基因与已知的E亚群内源性病毒代表株env基因的核苷酸序列同源性在98.5%以上,全基因组序列同源性在99.1%以上,而与其他亚群代表株同源性相对较低,env基因同源性仅为56.3%～91.5%.
摘要:以國內某3傢SPF鷄場的SPF鷄胚成纖維細胞提取的基因組DNA為模闆,參照已髮錶的序列,設計閤成瞭4對檢測內源性白血病病毒引物,分彆檢測gag基因、pol基因、env基因和LTR片段,結果顯示4者檢齣暘性率很高(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).設計閤成瞭8對引物,選取4片段檢測均為暘性的樣品之一,經PCR成功擴增齣瞭8段連續的、相互部分重疊的目的DNA片段,分彆連接入T載體進行剋隆測序.用DNAstar軟件對測序結果進行拼接,從一箇鷄胚得到瞭內源性白血病病毒前病毒全基因組序列.比較分析髮現,該序列env基因與已知的E亞群內源性病毒代錶株env基因的覈苷痠序列同源性在98.5%以上,全基因組序列同源性在99.1%以上,而與其他亞群代錶株同源性相對較低,env基因同源性僅為56.3%～91.5%.
적요:이국내모3가SPF계장적SPF계배성섬유세포제취적기인조DNA위모판,삼조이발표적서렬,설계합성료4대검측내원성백혈병병독인물,분별검측gag기인、pol기인、env기인화LTR편단,결과현시4자검출양성솔흔고(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).설계합성료8대인물,선취4편단검측균위양성적양품지일,경PCR성공확증출료8단련속적、상호부분중첩적목적DNA편단,분별련접입T재체진행극륭측서.용DNAstar연건대측서결과진행병접,종일개계배득도료내원성백혈병병독전병독전기인조서렬.비교분석발현,해서렬env기인여이지적E아군내원성병독대표주env기인적핵감산서렬동원성재98.5%이상,전기인조서렬동원성재99.1%이상,이여기타아군대표주동원성상대교저,env기인동원성부위56.3%～91.5%.
