华南农业大学学报
華南農業大學學報
화남농업대학학보
JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY
2007年
4期
95-99
,共5页
索青利%赵明秋%陈金顶%陈立军%黄忠强
索青利%趙明鞦%陳金頂%陳立軍%黃忠彊
색청리%조명추%진금정%진립군%황충강
口蹄疫病毒%基因组编码区%序列分析
口蹄疫病毒%基因組編碼區%序列分析
구제역병독%기인조편마구%서렬분석
参考GenBank中注册的O型口蹄疫病毒(FMDV)全基因序列,分段设计了9对引物,应用RT-PCR方法对G-01株的基因组编码区序列进行了克隆和序列测定,获得了该毒株基因组编码区的核苷酸序列(6 966 bp)并推导出其编码的氨基酸序列(2 322 aa).将获得的G-01株基因组编码区的核苷酸序列与参考的14株FMDV基因序列进行比较,结果表明,本毒株的3A蛋白的92～101位缺失10 aa,VP1基因的133～160位的关键位点没有变化,该毒株与以HKN/2002株为代表的7株O型毒株的同源性较高,与HKN/2002株遗传关系最近,而与另外7株O型毒株同源性较低,其遗传关系也较远.由此推断G-01与HKN/2002株属于遗传关系较近的毒株,这2株病毒有着相同的进化起源.
參攷GenBank中註冊的O型口蹄疫病毒(FMDV)全基因序列,分段設計瞭9對引物,應用RT-PCR方法對G-01株的基因組編碼區序列進行瞭剋隆和序列測定,穫得瞭該毒株基因組編碼區的覈苷痠序列(6 966 bp)併推導齣其編碼的氨基痠序列(2 322 aa).將穫得的G-01株基因組編碼區的覈苷痠序列與參攷的14株FMDV基因序列進行比較,結果錶明,本毒株的3A蛋白的92～101位缺失10 aa,VP1基因的133～160位的關鍵位點沒有變化,該毒株與以HKN/2002株為代錶的7株O型毒株的同源性較高,與HKN/2002株遺傳關繫最近,而與另外7株O型毒株同源性較低,其遺傳關繫也較遠.由此推斷G-01與HKN/2002株屬于遺傳關繫較近的毒株,這2株病毒有著相同的進化起源.
삼고GenBank중주책적O형구제역병독(FMDV)전기인서렬,분단설계료9대인물,응용RT-PCR방법대G-01주적기인조편마구서렬진행료극륭화서렬측정,획득료해독주기인조편마구적핵감산서렬(6 966 bp)병추도출기편마적안기산서렬(2 322 aa).장획득적G-01주기인조편마구적핵감산서렬여삼고적14주FMDV기인서렬진행비교,결과표명,본독주적3A단백적92～101위결실10 aa,VP1기인적133～160위적관건위점몰유변화,해독주여이HKN/2002주위대표적7주O형독주적동원성교고,여HKN/2002주유전관계최근,이여령외7주O형독주동원성교저,기유전관계야교원.유차추단G-01여HKN/2002주속우유전관계교근적독주,저2주병독유착상동적진화기원.
