西安交通大学学报(医学版)
西安交通大學學報(醫學版)
서안교통대학학보(의학판)
JOURNAL OF XI'AN JIAOTONG UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2007年
4期
422-426
,共5页
杨拴盈%田应选%南岩东%卜丽娜%霍树芬%阮禹松
楊拴盈%田應選%南巖東%蔔麗娜%霍樹芬%阮禹鬆
양전영%전응선%남암동%복려나%곽수분%원우송
人肺腺癌细胞系%蛋白质组学%双向电泳%基质辅助激光解吸离子化电离飞行时间质谱%肽指纹图谱
人肺腺癌細胞繫%蛋白質組學%雙嚮電泳%基質輔助激光解吸離子化電離飛行時間質譜%肽指紋圖譜
인폐선암세포계%단백질조학%쌍향전영%기질보조격광해흡리자화전리비행시간질보%태지문도보
目的 初步分析人肺腺癌细胞系A549细胞蛋白质表达情况,从蛋白组水平探讨肺腺癌发病的分子机制.方法 应用2-DE技术对人肺腺癌细胞系A549细胞总蛋白进行分离,获得蛋白质表达谱;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)结合生物信息学进行蛋白质鉴定.结果 3块胶平均蛋白斑点数为1 138±49,平均匹配点数为986±32,匹配率为85.8%.随机选取背景清晰、分辨清楚、蛋白含量较高的20个斑点进行MALDI-TOF-MS分析,共获得了18个肽质量指纹图谱(PMF).将PMFs质量数据通过Aldente软件查询SWISS-PROT数据库,根据匹配片段及氨基酸序列覆盖率等,初步鉴定出15种蛋白质.根据功能,这些蛋白质可分为:①基本代谢相关的酶类:果糖2-磷酸醛缩酶、视网醛脱氢酶1(RALDH1)、吡多醛激酶;②细胞骨架类:蛋白细胞角蛋白8(CK8)、β-2链微管蛋白;③应激相关蛋白:蛋白二硫化物异构酶A3(PDIA3);④ 信号转导分子:膜联蛋白1(ANX1)、膜联蛋白4(ANX4);⑤分子伴侣:热休克蛋白60(HSP60)、热休克蛋白β-1、抑制素(PHB);⑥转录及翻译相关蛋白:不均一性核糖核蛋白H(hnRNP H);⑦杂类:Rgr protein、NPM、PCBP1.结论 应用2-DE/MALDI-MS方法获得了较为理想的人肺腺癌细胞系A549细胞2-DE蛋白质表达谱,初步鉴定了15种蛋白质.
目的 初步分析人肺腺癌細胞繫A549細胞蛋白質錶達情況,從蛋白組水平探討肺腺癌髮病的分子機製.方法 應用2-DE技術對人肺腺癌細胞繫A549細胞總蛋白進行分離,穫得蛋白質錶達譜;應用基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)結閤生物信息學進行蛋白質鑒定.結果 3塊膠平均蛋白斑點數為1 138±49,平均匹配點數為986±32,匹配率為85.8%.隨機選取揹景清晰、分辨清楚、蛋白含量較高的20箇斑點進行MALDI-TOF-MS分析,共穫得瞭18箇肽質量指紋圖譜(PMF).將PMFs質量數據通過Aldente軟件查詢SWISS-PROT數據庫,根據匹配片段及氨基痠序列覆蓋率等,初步鑒定齣15種蛋白質.根據功能,這些蛋白質可分為:①基本代謝相關的酶類:果糖2-燐痠醛縮酶、視網醛脫氫酶1(RALDH1)、吡多醛激酶;②細胞骨架類:蛋白細胞角蛋白8(CK8)、β-2鏈微管蛋白;③應激相關蛋白:蛋白二硫化物異構酶A3(PDIA3);④ 信號轉導分子:膜聯蛋白1(ANX1)、膜聯蛋白4(ANX4);⑤分子伴侶:熱休剋蛋白60(HSP60)、熱休剋蛋白β-1、抑製素(PHB);⑥轉錄及翻譯相關蛋白:不均一性覈糖覈蛋白H(hnRNP H);⑦雜類:Rgr protein、NPM、PCBP1.結論 應用2-DE/MALDI-MS方法穫得瞭較為理想的人肺腺癌細胞繫A549細胞2-DE蛋白質錶達譜,初步鑒定瞭15種蛋白質.
목적 초보분석인폐선암세포계A549세포단백질표체정황,종단백조수평탐토폐선암발병적분자궤제.방법 응용2-DE기술대인폐선암세포계A549세포총단백진행분리,획득단백질표체보;응용기질보조격광해흡전리비행시간질보(MALDI-TOF-MS)결합생물신식학진행단백질감정.결과 3괴효평균단백반점수위1 138±49,평균필배점수위986±32,필배솔위85.8%.수궤선취배경청석、분변청초、단백함량교고적20개반점진행MALDI-TOF-MS분석,공획득료18개태질량지문도보(PMF).장PMFs질량수거통과Aldente연건사순SWISS-PROT수거고,근거필배편단급안기산서렬복개솔등,초보감정출15충단백질.근거공능,저사단백질가분위:①기본대사상관적매류:과당2-린산철축매、시망철탈경매1(RALDH1)、필다철격매;②세포골가류:단백세포각단백8(CK8)、β-2련미관단백;③응격상관단백:단백이류화물이구매A3(PDIA3);④ 신호전도분자:막련단백1(ANX1)、막련단백4(ANX4);⑤분자반려:열휴극단백60(HSP60)、열휴극단백β-1、억제소(PHB);⑥전록급번역상관단백:불균일성핵당핵단백H(hnRNP H);⑦잡류:Rgr protein、NPM、PCBP1.결론 응용2-DE/MALDI-MS방법획득료교위이상적인폐선암세포계A549세포2-DE단백질표체보,초보감정료15충단백질.