化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2006年
7期
691-697
,共7页
周鹏%田菲菲%李波%吴世容%李志良
週鵬%田菲菲%李波%吳世容%李誌良
주붕%전비비%리파%오세용%리지량
肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选%定量构效关系%遗传算法%偏最小二乘回归
肽/蛋白質結閤模式遺傳虛擬篩選%定量構效關繫%遺傳算法%偏最小二乘迴歸
태/단백질결합모식유전허의사선%정량구효관계%유전산법%편최소이승회귀
"合理"QSAR模型是指在了解配体与受体相互作用模式的前提下建立定量构效关系,这样避开了传统做法仅仅依靠样本集分子自身信息来构建预测模型的诸多弊端.本文将此思想应用于肽/蛋白质亲和活性的研究当中,借助于遗传算法作为虚拟受体结合靶点及相互作用模式的筛选手段得到了一种新的建模技术:肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选(genetic virtual screening of combinative mode for peptide/protein,GVSC).该法成功解决了"合理"QSAR研究中的难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解配基与之发生的结合方式.分别使用58个血管紧张素转化酶,18个Camel抗体蛋白cAb-lys3双位点突变残基对GVSC加以检验,其结果表明GVSC能够较好地阐明配基与受体之间的作用机理,并能得到优于传统方法的QSAR模型.
"閤理"QSAR模型是指在瞭解配體與受體相互作用模式的前提下建立定量構效關繫,這樣避開瞭傳統做法僅僅依靠樣本集分子自身信息來構建預測模型的諸多弊耑.本文將此思想應用于肽/蛋白質親和活性的研究噹中,藉助于遺傳算法作為虛擬受體結閤靶點及相互作用模式的篩選手段得到瞭一種新的建模技術:肽/蛋白質結閤模式遺傳虛擬篩選(genetic virtual screening of combinative mode for peptide/protein,GVSC).該法成功解決瞭"閤理"QSAR研究中的難題,即大多數情況下受體結構未知而難以瞭解配基與之髮生的結閤方式.分彆使用58箇血管緊張素轉化酶,18箇Camel抗體蛋白cAb-lys3雙位點突變殘基對GVSC加以檢驗,其結果錶明GVSC能夠較好地闡明配基與受體之間的作用機理,併能得到優于傳統方法的QSAR模型.
"합리"QSAR모형시지재료해배체여수체상호작용모식적전제하건립정량구효관계,저양피개료전통주법부부의고양본집분자자신신식래구건예측모형적제다폐단.본문장차사상응용우태/단백질친화활성적연구당중,차조우유전산법작위허의수체결합파점급상호작용모식적사선수단득도료일충신적건모기술:태/단백질결합모식유전허의사선(genetic virtual screening of combinative mode for peptide/protein,GVSC).해법성공해결료"합리"QSAR연구중적난제,즉대다수정황하수체결구미지이난이료해배기여지발생적결합방식.분별사용58개혈관긴장소전화매,18개Camel항체단백cAb-lys3쌍위점돌변잔기대GVSC가이검험,기결과표명GVSC능구교호지천명배기여수체지간적작용궤리,병능득도우우전통방법적QSAR모형.
