玉米科学
玉米科學
옥미과학
JOURNAL OF MAIZE SCIENCES
2011年
5期
19-24
,共6页
任禛%王建武%冯远娇%阮洋%赖建宁
任禛%王建武%馮遠嬌%阮洋%賴建寧
임진%왕건무%풍원교%원양%뢰건저
玉米%根系%AMF%克隆文库%多样性
玉米%根繫%AMF%剋隆文庫%多樣性
옥미%근계%AMF%극륭문고%다양성
以玉米根系为例,建立植物根系丛枝菌根18S rRNA基因克隆文库构建的方法.CTAB法提取的丛枝菌根真菌总DNA能够满足后续PCR扩增的要求.运用真菌引物GeoA2/Geo11及AMF特异引物AM1、AM2、AM3/NS31进行巢式PCR扩增,获得的产物连接转化入大肠杆菌构建18S rRNA部分基因克隆文库.通过限制性内切酶Hinf I、TaqI对随机挑选的50个克隆子进行ARDRA(Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis)分析,共获得11个差异图谱.每个图谱选择1个代表测序,结果表明,3个序列为玉米自身未知基因,其余8个都为Clomus属序列.文库评价统计结果发现,AMF克隆文库的Coverage值为72.4%,Rarefaction曲线趋于平缓,所建立文库的容量较为充足,能较全面地代表玉米根系AMF的多样性.
以玉米根繫為例,建立植物根繫叢枝菌根18S rRNA基因剋隆文庫構建的方法.CTAB法提取的叢枝菌根真菌總DNA能夠滿足後續PCR擴增的要求.運用真菌引物GeoA2/Geo11及AMF特異引物AM1、AM2、AM3/NS31進行巢式PCR擴增,穫得的產物連接轉化入大腸桿菌構建18S rRNA部分基因剋隆文庫.通過限製性內切酶Hinf I、TaqI對隨機挑選的50箇剋隆子進行ARDRA(Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis)分析,共穫得11箇差異圖譜.每箇圖譜選擇1箇代錶測序,結果錶明,3箇序列為玉米自身未知基因,其餘8箇都為Clomus屬序列.文庫評價統計結果髮現,AMF剋隆文庫的Coverage值為72.4%,Rarefaction麯線趨于平緩,所建立文庫的容量較為充足,能較全麵地代錶玉米根繫AMF的多樣性.
이옥미근계위례,건립식물근계총지균근18S rRNA기인극륭문고구건적방법.CTAB법제취적총지균근진균총DNA능구만족후속PCR확증적요구.운용진균인물GeoA2/Geo11급AMF특이인물AM1、AM2、AM3/NS31진행소식PCR확증,획득적산물련접전화입대장간균구건18S rRNA부분기인극륭문고.통과한제성내절매Hinf I、TaqI대수궤도선적50개극륭자진행ARDRA(Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis)분석,공획득11개차이도보.매개도보선택1개대표측서,결과표명,3개서렬위옥미자신미지기인,기여8개도위Clomus속서렬.문고평개통계결과발현,AMF극륭문고적Coverage치위72.4%,Rarefaction곡선추우평완,소건립문고적용량교위충족,능교전면지대표옥미근계AMF적다양성.