计算机工程与设计
計算機工程與設計
계산궤공정여설계
COMPUTER ENGINEERING AND DESIGN
2011年
5期
1833-1836
,共4页
蛋白质相互作用位点%进化保守性%序列谱%支持向量机%蛋白质结构数据库
蛋白質相互作用位點%進化保守性%序列譜%支持嚮量機%蛋白質結構數據庫
단백질상호작용위점%진화보수성%서렬보%지지향량궤%단백질결구수거고
为了从蛋白质结构数据库中提取经验知识,进行蛋白质作用位点预测,提出了以蛋白质序列谱作为特征向量,采用支持向量机算法进行训练和预测蛋白质相互作用位点的方法.从蛋白质一级序列出发,以序列上邻近残基的序列谱为输入特征向量,采用支持向量机方法构建预测器,来预测蛋白质相互作用位点,预测精度达到70.47%,相关系数CC=0.1919.实验结果表明,利用蛋白质序列谱,结合支持向量机算法进行蛋白质相互作用位点预测的方法是有效的.
為瞭從蛋白質結構數據庫中提取經驗知識,進行蛋白質作用位點預測,提齣瞭以蛋白質序列譜作為特徵嚮量,採用支持嚮量機算法進行訓練和預測蛋白質相互作用位點的方法.從蛋白質一級序列齣髮,以序列上鄰近殘基的序列譜為輸入特徵嚮量,採用支持嚮量機方法構建預測器,來預測蛋白質相互作用位點,預測精度達到70.47%,相關繫數CC=0.1919.實驗結果錶明,利用蛋白質序列譜,結閤支持嚮量機算法進行蛋白質相互作用位點預測的方法是有效的.
위료종단백질결구수거고중제취경험지식,진행단백질작용위점예측,제출료이단백질서렬보작위특정향량,채용지지향량궤산법진행훈련화예측단백질상호작용위점적방법.종단백질일급서렬출발,이서렬상린근잔기적서렬보위수입특정향량,채용지지향량궤방법구건예측기,래예측단백질상호작용위점,예측정도체도70.47%,상관계수CC=0.1919.실험결과표명,이용단백질서렬보,결합지지향량궤산법진행단백질상호작용위점예측적방법시유효적.
