计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2011年
4期
411-414
,共4页
蛋白质半衰期%亚细胞定位%胞内蛋白选择性降解%信号肽
蛋白質半衰期%亞細胞定位%胞內蛋白選擇性降解%信號肽
단백질반쇠기%아세포정위%포내단백선택성강해%신호태
胞内蛋白的稳定性直接影响着生命活动与细胞周期.蛋白的选择性降解是通过泛素-蛋白酶体途径实现的,它是蛋白消亡的主要方式之一,同时也是细胞主动调节自身状态的体现.蛋白的稳定性除了与自身序列和结构相关外,还和成熟蛋白所处的细胞内环境,即蛋白的亚细胞定位有关.本文主要从蛋白质在细胞中的区域化分布角度研究其与蛋白寿命的关系.结合大量的蛋白半衰期实验数据以及生物信息数据库,文章统计并分析了每个蛋白的定位信息,并进一步研究了与定位有关的信号肽情况,以及应用F检验筛选出了部分能够显著区分长短寿命蛋白的N端序列特征.结果表明胞内蛋白半衰期与其亚细胞定位之间存在一定的关联性.短寿命蛋白往往定位于细胞膜或者膜性囊泡结构上,大多由信号肽引导定位,作为细胞的分泌蛋白、信号转导蛋白或者功能性蛋白发挥作用并迅速降解;而长寿命蛋白多数属于持家蛋白,定位于细胞胞浆中或直接在胞浆中合成,作为细胞骨架或者发挥着支撑细胞的作用.另外,蛋白的区域化分布影响着蛋白质的折叠、聚合以及翻译后修饰,这些过程与蛋白的稳定性有着密切的联系.本研究为将来蛋白稳定性的深入研究提供了新的思路,同时也为生物信息学中开发蛋白质稳定性相关的预测工具提供了参考.
胞內蛋白的穩定性直接影響著生命活動與細胞週期.蛋白的選擇性降解是通過汎素-蛋白酶體途徑實現的,它是蛋白消亡的主要方式之一,同時也是細胞主動調節自身狀態的體現.蛋白的穩定性除瞭與自身序列和結構相關外,還和成熟蛋白所處的細胞內環境,即蛋白的亞細胞定位有關.本文主要從蛋白質在細胞中的區域化分佈角度研究其與蛋白壽命的關繫.結閤大量的蛋白半衰期實驗數據以及生物信息數據庫,文章統計併分析瞭每箇蛋白的定位信息,併進一步研究瞭與定位有關的信號肽情況,以及應用F檢驗篩選齣瞭部分能夠顯著區分長短壽命蛋白的N耑序列特徵.結果錶明胞內蛋白半衰期與其亞細胞定位之間存在一定的關聯性.短壽命蛋白往往定位于細胞膜或者膜性囊泡結構上,大多由信號肽引導定位,作為細胞的分泌蛋白、信號轉導蛋白或者功能性蛋白髮揮作用併迅速降解;而長壽命蛋白多數屬于持傢蛋白,定位于細胞胞漿中或直接在胞漿中閤成,作為細胞骨架或者髮揮著支撐細胞的作用.另外,蛋白的區域化分佈影響著蛋白質的摺疊、聚閤以及翻譯後脩飾,這些過程與蛋白的穩定性有著密切的聯繫.本研究為將來蛋白穩定性的深入研究提供瞭新的思路,同時也為生物信息學中開髮蛋白質穩定性相關的預測工具提供瞭參攷.
포내단백적은정성직접영향착생명활동여세포주기.단백적선택성강해시통과범소-단백매체도경실현적,타시단백소망적주요방식지일,동시야시세포주동조절자신상태적체현.단백적은정성제료여자신서렬화결구상관외,환화성숙단백소처적세포내배경,즉단백적아세포정위유관.본문주요종단백질재세포중적구역화분포각도연구기여단백수명적관계.결합대량적단백반쇠기실험수거이급생물신식수거고,문장통계병분석료매개단백적정위신식,병진일보연구료여정위유관적신호태정황,이급응용F검험사선출료부분능구현저구분장단수명단백적N단서렬특정.결과표명포내단백반쇠기여기아세포정위지간존재일정적관련성.단수명단백왕왕정위우세포막혹자막성낭포결구상,대다유신호태인도정위,작위세포적분비단백、신호전도단백혹자공능성단백발휘작용병신속강해;이장수명단백다수속우지가단백,정위우세포포장중혹직접재포장중합성,작위세포골가혹자발휘착지탱세포적작용.령외,단백적구역화분포영향착단백질적절첩、취합이급번역후수식,저사과정여단백적은정성유착밀절적련계.본연구위장래단백은정성적심입연구제공료신적사로,동시야위생물신식학중개발단백질은정성상관적예측공구제공료삼고.