植物遗传资源学报
植物遺傳資源學報
식물유전자원학보
JOURNAL OF PLANT GENETLC RESOURCES
2010年
6期
772-776
,共5页
李雪姣%张耿%顾爱侠%轩淑欣%王彦华%赵建军
李雪姣%張耿%顧愛俠%軒淑訢%王彥華%趙建軍
리설교%장경%고애협%헌숙흔%왕언화%조건군
芸薹属%序列表达标签(EST)%单核苷酸多态性(SNP)%分子标记
蕓薹屬%序列錶達標籤(EST)%單覈苷痠多態性(SNP)%分子標記
예대속%서렬표체표첨(EST)%단핵감산다태성(SNP)%분자표기
芸薹属作物是十字花科中重要的蔬菜和油用作物,经济价值和食用价值比较高.本研究通过生物信息学手段,从3个芸薹属物种EST序列中获得了大量的SNP和Indel资源,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性、Indel碱基数量与发生频率之间的关系进行了分析.分析结果对深入研究芸薹属基因组特点具有一定的参考价值,为进一步通过试验验证预测的SNP位点、开发该作物高通量SNP分子标记奠定了基础.
蕓薹屬作物是十字花科中重要的蔬菜和油用作物,經濟價值和食用價值比較高.本研究通過生物信息學手段,從3箇蕓薹屬物種EST序列中穫得瞭大量的SNP和Indel資源,對SNP與EST的數量及拼接結果之間的關繫、SNP堿基置換的偏好性、Indel堿基數量與髮生頻率之間的關繫進行瞭分析.分析結果對深入研究蕓薹屬基因組特點具有一定的參攷價值,為進一步通過試驗驗證預測的SNP位點、開髮該作物高通量SNP分子標記奠定瞭基礎.
예대속작물시십자화과중중요적소채화유용작물,경제개치화식용개치비교고.본연구통과생물신식학수단,종3개예대속물충EST서렬중획득료대량적SNP화Indel자원,대SNP여EST적수량급병접결과지간적관계、SNP감기치환적편호성、Indel감기수량여발생빈솔지간적관계진행료분석.분석결과대심입연구예대속기인조특점구유일정적삼고개치,위진일보통과시험험증예측적SNP위점、개발해작물고통량SNP분자표기전정료기출.
