家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2012年
2期
25-30
,共6页
袁峰%苗永旺%王绍卿%李大林%袁跃云
袁峰%苗永旺%王紹卿%李大林%袁躍雲
원봉%묘영왕%왕소경%리대림%원약운
家养水牛%催乳素基因%编码区%PCR-SSCP
傢養水牛%催乳素基因%編碼區%PCR-SSCP
가양수우%최유소기인%편마구%PCR-SSCP
催乳素具有促进生长发育及维持泌乳、进行免疫调节等生物学功能,但目前家养水牛PRL基因的变异特征及其与水牛性状间的关系还不清楚.本研究采用PCR-SSCP及PCR产物直接测序技术,检测不同沼泽型和河流型水牛群体PRL基因各外显子的遗传变异,将各外显子序列进行拼接得到编码区序列,对其进行生物信息学分析,结果表明:水牛成熟催乳素含199个氨基酸残基,其编码蛋白呈酸性,碱基使用率为A 25.96％,T 22.95％,C 28.14％,G22.95％,平均碱基组成差异较小,偏好性密码子占密码子使用总数的48.21％.在沼泽型水牛群体中检测到c.G192A、c.C427T和c.C606T共3种核苷酸替换,均为同义替换,产生8种单倍型,在河流型水牛群体中检测到c.C606T替换,为同义替换,产生2种单倍型,不同单倍型个体未产生表达差异.序列比对分析表明,水牛PRL基因编码区序列在进化过程中未受到人工选择的影响,可能是因为功能的约束使其编码区序列表现得十分保守.
催乳素具有促進生長髮育及維持泌乳、進行免疫調節等生物學功能,但目前傢養水牛PRL基因的變異特徵及其與水牛性狀間的關繫還不清楚.本研究採用PCR-SSCP及PCR產物直接測序技術,檢測不同沼澤型和河流型水牛群體PRL基因各外顯子的遺傳變異,將各外顯子序列進行拼接得到編碼區序列,對其進行生物信息學分析,結果錶明:水牛成熟催乳素含199箇氨基痠殘基,其編碼蛋白呈痠性,堿基使用率為A 25.96％,T 22.95％,C 28.14％,G22.95％,平均堿基組成差異較小,偏好性密碼子佔密碼子使用總數的48.21％.在沼澤型水牛群體中檢測到c.G192A、c.C427T和c.C606T共3種覈苷痠替換,均為同義替換,產生8種單倍型,在河流型水牛群體中檢測到c.C606T替換,為同義替換,產生2種單倍型,不同單倍型箇體未產生錶達差異.序列比對分析錶明,水牛PRL基因編碼區序列在進化過程中未受到人工選擇的影響,可能是因為功能的約束使其編碼區序列錶現得十分保守.
최유소구유촉진생장발육급유지비유、진행면역조절등생물학공능,단목전가양수우PRL기인적변이특정급기여수우성상간적관계환불청초.본연구채용PCR-SSCP급PCR산물직접측서기술,검측불동소택형화하류형수우군체PRL기인각외현자적유전변이,장각외현자서렬진행병접득도편마구서렬,대기진행생물신식학분석,결과표명:수우성숙최유소함199개안기산잔기,기편마단백정산성,감기사용솔위A 25.96％,T 22.95％,C 28.14％,G22.95％,평균감기조성차이교소,편호성밀마자점밀마자사용총수적48.21％.재소택형수우군체중검측도c.G192A、c.C427T화c.C606T공3충핵감산체환,균위동의체환,산생8충단배형,재하류형수우군체중검측도c.C606T체환,위동의체환,산생2충단배형,불동단배형개체미산생표체차이.서렬비대분석표명,수우PRL기인편마구서렬재진화과정중미수도인공선택적영향,가능시인위공능적약속사기편마구서렬표현득십분보수.
