微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2008年
5期
701-706
,共6页
李献梅%王小芬%杨洪岩%高秀芝%崔宗均
李獻梅%王小芬%楊洪巖%高秀芝%崔宗均
리헌매%왕소분%양홍암%고수지%최종균
促旋酶%gyrB%近缘种%系统发育
促鏇酶%gyrB%近緣種%繫統髮育
촉선매%gyrB%근연충%계통발육
单拷贝的gyrB是普遍存在于细菌中编码促旋酶B亚单位的基因,该基因进化速率快,每100万年的平均碱基替换率为0.7%～0.8%.研究证明,该区段基因能对假单胞菌、芽孢杆菌、弧菌、肠杆菌、分枝杆菌、气单胞菌、乳酸菌等不同属或科内的近缘种进行区分鉴定,还可通过设计种特异性引物进行定量PCR或者限制性片段分析,同时也能结合变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)追踪微生物的动态.gyrB基因弥补了非蛋白编码基因16S rDNA或者基因间隔序列(ITS)DNA无法区分近缘种的缺陷,给近缘种的鉴别或者其群体指纹图谱的分析带来了新的希望,为当前国内外用于近缘种研究的热点,是细菌系统发育分析上非常值得重视的新靶标.
單拷貝的gyrB是普遍存在于細菌中編碼促鏇酶B亞單位的基因,該基因進化速率快,每100萬年的平均堿基替換率為0.7%～0.8%.研究證明,該區段基因能對假單胞菌、芽孢桿菌、弧菌、腸桿菌、分枝桿菌、氣單胞菌、乳痠菌等不同屬或科內的近緣種進行區分鑒定,還可通過設計種特異性引物進行定量PCR或者限製性片段分析,同時也能結閤變性梯度凝膠電泳技術(DGGE)追蹤微生物的動態.gyrB基因瀰補瞭非蛋白編碼基因16S rDNA或者基因間隔序列(ITS)DNA無法區分近緣種的缺陷,給近緣種的鑒彆或者其群體指紋圖譜的分析帶來瞭新的希望,為噹前國內外用于近緣種研究的熱點,是細菌繫統髮育分析上非常值得重視的新靶標.
단고패적gyrB시보편존재우세균중편마촉선매B아단위적기인,해기인진화속솔쾌,매100만년적평균감기체환솔위0.7%～0.8%.연구증명,해구단기인능대가단포균、아포간균、호균、장간균、분지간균、기단포균、유산균등불동속혹과내적근연충진행구분감정,환가통과설계충특이성인물진행정량PCR혹자한제성편단분석,동시야능결합변성제도응효전영기술(DGGE)추종미생물적동태.gyrB기인미보료비단백편마기인16S rDNA혹자기인간격서렬(ITS)DNA무법구분근연충적결함,급근연충적감별혹자기군체지문도보적분석대래료신적희망,위당전국내외용우근연충연구적열점,시세균계통발육분석상비상치득중시적신파표.
