CAJ | 학술논문

目的从基因表达水平和外显子选择性剪接水平探讨肌萎缩侧索硬化(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)模型鼠(hSOD1-G93A基因型阳性小鼠)发病相关的基因和信号通路,分析症状前期转录水平的改变及可能的发病启动机制.方法筛选鉴定hSOD1-G93A基因型阳性雌性小鼠发病早期(30 d)做研究组(30A组),以同窝同龄SOD1-G93A基因型阴性雌性小鼠做对照组(30C组),应用Affymetrix小鼠外显子芯片检测小鼠腰髓组织的基因转录本及可变剪接事件,并对相关基因进行功能分类(gene ontology hierarchy analysis,GO分类)及生物学通路分析.结果在30A组和30C组两组比较中,基因表达谱水平仅有1个基因(未知基因)在30A组中表达高于30C组2倍以上,共有4个基因在30A组的表达高于30C组1.5倍以上,且仅有1个基因为已知基因(NM_030707).未发现有1.5倍以上表达下调的基因.在外显子水平,共有85个发生选择性剪接的外显子,分别属于85个转录本,仅有36个已知基因.对NM_030707基因及36个可变剪接基因进行GO分析及通路分析,得出其功能及涉及的信号转导通路.结论与30C组相比,在基因表达水平,致病性hSOD1-G93A在ALS症状前期影响不大;在转录水平,发现了新的异常剪接基因.推测出现的新基因及新的异常剪接事件可能与hSOD1-G93A基因在症状前期致病性有关.
목적 종기인표체수평화외현자선택성전접수평탐토기위축측색경화(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)모형서(hSOD1-G93A기인형양성소서)발병상관적기인화신호통로,분석증상전기전록수평적개변급가능적발병계동궤제.방법 사선감정hSOD1-G93A기인형양성자성소서발병조기(30 d)주연구조(30A조),이동와동령SOD1-G93A기인형음성자성소서주대조조(30C조),응용Affymetrix소서외현자심편검측소서요수조직적기인전록본급가변전접사건,병대상관기인진행공능분류(gene ontology hierarchy analysis,GO분류)급생물학통로분석.결과 재30A조화30C조량조비교중,기인표체보수평부유1개기인(미지기인)재30A조중표체고우30C조2배이상,공유4개기인재30A조적표체고우30C조1.5배이상,차부유1개기인위이지기인(NM_030707).미발현유1.5배이상표체하조적기인.재외현자수평,공유85개발생선택성전접적외현자,분별속우85개전록본,부유36개이지기인.대NM_030707기인급36개가변전접기인진행GO분석급통로분석,득출기공능급섭급적신호전도통로.결론 여30C조상비,재기인표체수평,치병성hSOD1-G93A재ALS증상전기영향불대;재전록수평,발현료신적이상전접기인.추측출현적신기인급신적이상전접사건가능여hSOD1-G93A기인재증상전기치병성유관.