CAJ | 학술논문

利用1对特异性引物DABF和DABR,分别从30尾感病和13尾抗病“粉玉”体色瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)的cDNA中扩增出长度为624 bp的MHC classⅡB基因片段.对210个有效克隆进行测序,获得84个不同的编码序列,分属13个不同的等位基因,其中Cyca-DAB3*17和Cyca-DAB3 *18为新发现的2个等位基因.核苷酸、氨基酸变异位点总数为267、130,变异率较高( 42.79％、62.50％).MHCⅡB基因片段包括第1-4个外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区.β1结构域的变异明显大于β2结构域,表现为在长度为276 bp的β1结构域中,核苷酸、氨基酸变异位点分别为150个(54.35％)和72个(78.26％)；而长度为282bp的β2结构域的核苷酸、氨基酸变异位点较少,分别为105个(37.23％)和54个(57.45％).在p1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有22个发生了变异.β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的非同义碱基替换率(dN)与同义碱基替换率(ds)的比值w分别为1.366、0.992、0.792,表明“粉玉”体色瓯江彩鲤MHC classⅡB基因的β1结构域在进化过程中受到正向选择作用.基因Cyca-DAB3 *09在抗病群体中出现的频率(7.81％)显著高于感病群体(1.37％,P＜0.05),新等位基因Cyc-DAB3*18(频率为3.13％)只出现在抗病群体中,基因Cyca-DAB1 *08、Cyca-DAB3 *08和Cyca-DAB3*17为感病群体所特有.研究结果为抗病“粉玉”体色瓯江彩鲤的选育奠定了基础.
이용1대특이성인물DABF화DABR,분별종30미감병화13미항병“분옥”체색구강채리(Cyprinus carpio var.color)적cDNA중확증출장도위624 bp적MHC classⅡB기인편단.대210개유효극륭진행측서,획득84개불동적편마서렬,분속13개불동적등위기인,기중Cyca-DAB3*17화Cyca-DAB3 *18위신발현적2개등위기인.핵감산、안기산변이위점총수위267、130,변이솔교고( 42.79％、62.50％).MHCⅡB기인편단포괄제1-4개외현자,분별편마신호태、β1화β2결구역급과막구.β1결구역적변이명현대우β2결구역,표현위재장도위276 bp적β1결구역중,핵감산、안기산변이위점분별위150개(54.35％)화72개(78.26％)；이장도위282bp적β2결구역적핵감산、안기산변이위점교소,분별위105개(37.23％)화54개(57.45％).재p1결구역적24개항원결합위점(PBR)상,유22개발생료변이.β1결구역적PBR、비항원결합위점(non-PBR)급β2결구역적비동의감기체환솔(dN)여동의감기체환솔(ds)적비치w분별위1.366、0.992、0.792,표명“분옥”체색구강채리MHC classⅡB기인적β1결구역재진화과정중수도정향선택작용.기인Cyca-DAB3 *09재항병군체중출현적빈솔(7.81％)현저고우감병군체(1.37％,P＜0.05),신등위기인Cyc-DAB3*18(빈솔위3.13％)지출현재항병군체중,기인Cyca-DAB1 *08、Cyca-DAB3 *08화Cyca-DAB3*17위감병군체소특유.연구결과위항병“분옥”체색구강채리적선육전정료기출.