内蒙古大学学报(自然科学版)
內矇古大學學報(自然科學版)
내몽고대학학보(자연과학판)
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NEIMONGOL
2008年
2期
159-165
,共7页
陈颖丽%李前忠%樊国梁%杨科利
陳穎麗%李前忠%樊國樑%楊科利
진영려%리전충%번국량%양과리
细胞凋亡蛋白%支持向量机%肽组分%亲疏水性分布
細胞凋亡蛋白%支持嚮量機%肽組分%親疏水性分佈
세포조망단백%지지향량궤%태조분%친소수성분포
基于支持向量机,以全部和局部氨基酸序列的n肽组分、序列的亲疏水性分布等五种特征提取方法构成特征向量表示蛋白质序列,对六类细胞凋亡蛋白的亚细胞位置进行预测.结果表明,基于氨基酸二肽组成成分构成的特征向量集(以符号DIPE表示)的预测结果高于其它四种特征向量集的预测结果,在Jackknife检验下,总预测成功率达到了89.3%;与现有的方法比较,发现对于Mitochondrial类凋亡蛋白,支持向量机方法有更好的预测效果.
基于支持嚮量機,以全部和跼部氨基痠序列的n肽組分、序列的親疏水性分佈等五種特徵提取方法構成特徵嚮量錶示蛋白質序列,對六類細胞凋亡蛋白的亞細胞位置進行預測.結果錶明,基于氨基痠二肽組成成分構成的特徵嚮量集(以符號DIPE錶示)的預測結果高于其它四種特徵嚮量集的預測結果,在Jackknife檢驗下,總預測成功率達到瞭89.3%;與現有的方法比較,髮現對于Mitochondrial類凋亡蛋白,支持嚮量機方法有更好的預測效果.
기우지지향량궤,이전부화국부안기산서렬적n태조분、서렬적친소수성분포등오충특정제취방법구성특정향량표시단백질서렬,대륙류세포조망단백적아세포위치진행예측.결과표명,기우안기산이태조성성분구성적특정향량집(이부호DIPE표시)적예측결과고우기타사충특정향량집적예측결과,재Jackknife검험하,총예측성공솔체도료89.3%;여현유적방법비교,발현대우Mitochondrial류조망단백,지지향량궤방법유경호적예측효과.