中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2011年
12期
1082-1085
,共4页
单晓枫%吴同垒%孟庆峰%王伟利%钱爱东
單曉楓%吳同壘%孟慶峰%王偉利%錢愛東
단효풍%오동루%맹경봉%왕위리%전애동
维氏气单胞菌%外膜蛋白AⅡ%克隆%序列分析%生物信息学
維氏氣單胞菌%外膜蛋白AⅡ%剋隆%序列分析%生物信息學
유씨기단포균%외막단백AⅡ%극륭%서렬분석%생물신식학
目的 克隆维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,AV)吉林株外膜蛋白AⅡ(OMPAⅡ)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.方法 根据维氏气单胞菌已知OMPAⅡ基因序列设计合成一对引物,通过PCR技术扩增OMPAⅡ基因,并将其克隆到pMD18-T载体上,阳性重组质粒经PCR鉴定后进行序列测定,通过BlastN分析维氏气单胞菌OMPAⅡ基因序列与其他菌种OMPAⅡ序列同源性,并构建系统进化树,同时对维氏气单胞菌OMPAⅡ蛋白进行生物信息学分析.结果 克隆基因长1 001 bp,与GenBank报道的基因序列同源性为95％,生物信息学软件分析OMPAⅡ蛋白无跨膜区,其N端含有1个信号肽,二级结构以β折叠和β转角为主,有10个区域可能存在B细胞抗原表位.结论 成功的克隆维氏气单胞菌OMPAⅡ基因,并对OMPAⅡ蛋白的相关生物信息学进行了分析.
目的 剋隆維氏氣單胞菌(Aeromonas veronii,AV)吉林株外膜蛋白AⅡ(OMPAⅡ)基因,併對其編碼蛋白進行生物信息學分析.方法 根據維氏氣單胞菌已知OMPAⅡ基因序列設計閤成一對引物,通過PCR技術擴增OMPAⅡ基因,併將其剋隆到pMD18-T載體上,暘性重組質粒經PCR鑒定後進行序列測定,通過BlastN分析維氏氣單胞菌OMPAⅡ基因序列與其他菌種OMPAⅡ序列同源性,併構建繫統進化樹,同時對維氏氣單胞菌OMPAⅡ蛋白進行生物信息學分析.結果 剋隆基因長1 001 bp,與GenBank報道的基因序列同源性為95％,生物信息學軟件分析OMPAⅡ蛋白無跨膜區,其N耑含有1箇信號肽,二級結構以β摺疊和β轉角為主,有10箇區域可能存在B細胞抗原錶位.結論 成功的剋隆維氏氣單胞菌OMPAⅡ基因,併對OMPAⅡ蛋白的相關生物信息學進行瞭分析.
목적 극륭유씨기단포균(Aeromonas veronii,AV)길림주외막단백AⅡ(OMPAⅡ)기인,병대기편마단백진행생물신식학분석.방법 근거유씨기단포균이지OMPAⅡ기인서렬설계합성일대인물,통과PCR기술확증OMPAⅡ기인,병장기극륭도pMD18-T재체상,양성중조질립경PCR감정후진행서렬측정,통과BlastN분석유씨기단포균OMPAⅡ기인서렬여기타균충OMPAⅡ서렬동원성,병구건계통진화수,동시대유씨기단포균OMPAⅡ단백진행생물신식학분석.결과 극륭기인장1 001 bp,여GenBank보도적기인서렬동원성위95％,생물신식학연건분석OMPAⅡ단백무과막구,기N단함유1개신호태,이급결구이β절첩화β전각위주,유10개구역가능존재B세포항원표위.결론 성공적극륭유씨기단포균OMPAⅡ기인,병대OMPAⅡ단백적상관생물신식학진행료분석.
