清华大学学报（自然科学版）
清華大學學報（自然科學版）
청화대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF TSINGHUA UNIVERSITY SCIENCE AND TECHNOLOGY
2006年
7期
1267-1270
,共4页
荀靓%张利%甄一松%惠汝太
荀靚%張利%甄一鬆%惠汝太
순정%장리%견일송%혜여태
生物信息%基因调控%转录因子结合位点%启动子%肝脏特异表达
生物信息%基因調控%轉錄因子結閤位點%啟動子%肝髒特異錶達
생물신식%기인조공%전록인자결합위점%계동자%간장특이표체
为了寻找启动子区域上转录因子结合位点的分布规律,进而研究这种规律与真核基因表达调控机制之间的关系,该文从已有数据出发,运用位置权重矩阵(PWM)扫描算法对启动子区域上4种与肝脏特异表达相关的转录因子结合位点分布情况进行了初步研究,并提出了一种新的序列评分方法.通过该方法提取的统计特征,肝脏特异基因的鉴别准确率可以达93.33%.实验结果表明: 肝脏特异基因的启动子区域上结合位点的分布情况与其他基因相比存在显著差异. 新的序列评分方法可以更好地反映这种差异性,实现肝脏特异基因的精确鉴别.
為瞭尋找啟動子區域上轉錄因子結閤位點的分佈規律,進而研究這種規律與真覈基因錶達調控機製之間的關繫,該文從已有數據齣髮,運用位置權重矩陣(PWM)掃描算法對啟動子區域上4種與肝髒特異錶達相關的轉錄因子結閤位點分佈情況進行瞭初步研究,併提齣瞭一種新的序列評分方法.通過該方法提取的統計特徵,肝髒特異基因的鑒彆準確率可以達93.33%.實驗結果錶明: 肝髒特異基因的啟動子區域上結閤位點的分佈情況與其他基因相比存在顯著差異. 新的序列評分方法可以更好地反映這種差異性,實現肝髒特異基因的精確鑒彆.
위료심조계동자구역상전록인자결합위점적분포규률,진이연구저충규률여진핵기인표체조공궤제지간적관계,해문종이유수거출발,운용위치권중구진(PWM)소묘산법대계동자구역상4충여간장특이표체상관적전록인자결합위점분포정황진행료초보연구,병제출료일충신적서렬평분방법.통과해방법제취적통계특정,간장특이기인적감별준학솔가이체93.33%.실험결과표명: 간장특이기인적계동자구역상결합위점적분포정황여기타기인상비존재현저차이. 신적서렬평분방법가이경호지반영저충차이성,실현간장특이기인적정학감별.
