大连海洋大学学报
大連海洋大學學報
대련해양대학학보
JOURNAL OF DALIAN FISHERIES UNIVERSITY
2011年
6期
507-513
,共7页
周一兵%陈雪%杨大佐%万良%王斌%王丽丽%孙静波
週一兵%陳雪%楊大佐%萬良%王斌%王麗麗%孫靜波
주일병%진설%양대좌%만량%왕빈%왕려려%손정파
双齿围沙蚕%CYP4%RACE%生物信息学分析
雙齒圍沙蠶%CYP4%RACE%生物信息學分析
쌍치위사잠%CYP4%RACE%생물신식학분석
根据已知的绿沙蚕Nereis virens细胞色素氧化酶CYP342A1保守区设计引物,采用RACE技术首次从双齿围沙蚕Perinereis aibuhitensis体壁肌肉中克隆出细胞色素氧化酶CYP4基因全长序列.分析结果表明,该序列全长为1 857 bp,5’端非翻译区为186 bp,3’端非翻译区为225 bp,阅读框为1 446 bp,编码为481个氨基酸.第422 ～431氨基酸序列符合P450所具有的结构保守共有序列FxxGxxxCxG,第319～ 322氨基酸序列为K螺旋特征基序ExxR区,第282 ～294氨基酸序列含有CYP4家族特征序列EVDTFMFEGHDTT.经Blast与GenBank中已知物种的氨基酸序列进行同源性比对,CYP4与多毛类绿沙蚕Nereis virens CYP4BB1、CYP342A1 (AY453408)氨基酸同源性为73％、36％,与多毛类小头虫Capitella capitata CYP4AT1( AY574044)同源性为39％.据此推断,双齿围沙蚕CYP4基因属于CYP4B亚家族.
根據已知的綠沙蠶Nereis virens細胞色素氧化酶CYP342A1保守區設計引物,採用RACE技術首次從雙齒圍沙蠶Perinereis aibuhitensis體壁肌肉中剋隆齣細胞色素氧化酶CYP4基因全長序列.分析結果錶明,該序列全長為1 857 bp,5’耑非翻譯區為186 bp,3’耑非翻譯區為225 bp,閱讀框為1 446 bp,編碼為481箇氨基痠.第422 ～431氨基痠序列符閤P450所具有的結構保守共有序列FxxGxxxCxG,第319～ 322氨基痠序列為K螺鏇特徵基序ExxR區,第282 ～294氨基痠序列含有CYP4傢族特徵序列EVDTFMFEGHDTT.經Blast與GenBank中已知物種的氨基痠序列進行同源性比對,CYP4與多毛類綠沙蠶Nereis virens CYP4BB1、CYP342A1 (AY453408)氨基痠同源性為73％、36％,與多毛類小頭蟲Capitella capitata CYP4AT1( AY574044)同源性為39％.據此推斷,雙齒圍沙蠶CYP4基因屬于CYP4B亞傢族.
근거이지적록사잠Nereis virens세포색소양화매CYP342A1보수구설계인물,채용RACE기술수차종쌍치위사잠Perinereis aibuhitensis체벽기육중극륭출세포색소양화매CYP4기인전장서렬.분석결과표명,해서렬전장위1 857 bp,5’단비번역구위186 bp,3’단비번역구위225 bp,열독광위1 446 bp,편마위481개안기산.제422 ～431안기산서렬부합P450소구유적결구보수공유서렬FxxGxxxCxG,제319～ 322안기산서렬위K라선특정기서ExxR구,제282 ～294안기산서렬함유CYP4가족특정서렬EVDTFMFEGHDTT.경Blast여GenBank중이지물충적안기산서렬진행동원성비대,CYP4여다모류록사잠Nereis virens CYP4BB1、CYP342A1 (AY453408)안기산동원성위73％、36％,여다모류소두충Capitella capitata CYP4AT1( AY574044)동원성위39％.거차추단,쌍치위사잠CYP4기인속우CYP4B아가족.
