中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2012年
7期
653-658,663
,共7页
郭志云%杨光%荆春霞%付芹芹%孙小会%王穗湘%李月琴%周天鸿
郭誌雲%楊光%荊春霞%付芹芹%孫小會%王穗湘%李月琴%週天鴻
곽지운%양광%형춘하%부근근%손소회%왕수상%리월금%주천홍
微小隐孢子虫%EF-hand结构域%Ca2+%生物信息学分析%功能预测
微小隱孢子蟲%EF-hand結構域%Ca2+%生物信息學分析%功能預測
미소은포자충%EF-hand결구역%Ca2+%생물신식학분석%공능예측
目的 对微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum,Cp)含EF-hand结构域家族蛋白进行生物信息学研究,探讨该家族蛋白的EF-hand结构域与Ca2+信号的关系以预测该家族蛋白的功能,为隐孢子虫病的诊断和治疗提供新的方向.方法 首先通过数据收集,获得EF-hand结构域家族蛋白的序列信息,接着对每个蛋白进行CDD结构域搜索和NCBI BLAST 的比对分析,确证为EF-hand结构域家族蛋白,最后进行结构域分析和功能预测.结果 搜索到了C.parvum Iowa Ⅱ中18个含有EF-hand结构域的蛋白,它们之间的氨基酸长度,分子量大小以及等电点等都有很大的区别,通过结构域分析把EF-hand家族分成了含一个EF-hand结构域、二个EF-hand结构域、同时含EF-hand和STKc-AGC两种结构域和同时含EF-hand和PKC两种结构域四大类.结论 EF-hand结构域蛋白家族与重要的钙离子信号作用有着密切的关系,而C.parvum对宿主细胞的侵袭能力与胞内的Ca2+水平密切相关,所以EF-hand蛋白家族很有可能成为隐孢子虫病治疗的一个新的突破点.
目的 對微小隱孢子蟲(Cryptosporidium parvum,Cp)含EF-hand結構域傢族蛋白進行生物信息學研究,探討該傢族蛋白的EF-hand結構域與Ca2+信號的關繫以預測該傢族蛋白的功能,為隱孢子蟲病的診斷和治療提供新的方嚮.方法 首先通過數據收集,穫得EF-hand結構域傢族蛋白的序列信息,接著對每箇蛋白進行CDD結構域搜索和NCBI BLAST 的比對分析,確證為EF-hand結構域傢族蛋白,最後進行結構域分析和功能預測.結果 搜索到瞭C.parvum Iowa Ⅱ中18箇含有EF-hand結構域的蛋白,它們之間的氨基痠長度,分子量大小以及等電點等都有很大的區彆,通過結構域分析把EF-hand傢族分成瞭含一箇EF-hand結構域、二箇EF-hand結構域、同時含EF-hand和STKc-AGC兩種結構域和同時含EF-hand和PKC兩種結構域四大類.結論 EF-hand結構域蛋白傢族與重要的鈣離子信號作用有著密切的關繫,而C.parvum對宿主細胞的侵襲能力與胞內的Ca2+水平密切相關,所以EF-hand蛋白傢族很有可能成為隱孢子蟲病治療的一箇新的突破點.
목적 대미소은포자충(Cryptosporidium parvum,Cp)함EF-hand결구역가족단백진행생물신식학연구,탐토해가족단백적EF-hand결구역여Ca2+신호적관계이예측해가족단백적공능,위은포자충병적진단화치료제공신적방향.방법 수선통과수거수집,획득EF-hand결구역가족단백적서렬신식,접착대매개단백진행CDD결구역수색화NCBI BLAST 적비대분석,학증위EF-hand결구역가족단백,최후진행결구역분석화공능예측.결과 수색도료C.parvum Iowa Ⅱ중18개함유EF-hand결구역적단백,타문지간적안기산장도,분자량대소이급등전점등도유흔대적구별,통과결구역분석파EF-hand가족분성료함일개EF-hand결구역、이개EF-hand결구역、동시함EF-hand화STKc-AGC량충결구역화동시함EF-hand화PKC량충결구역사대류.결론 EF-hand결구역단백가족여중요적개리자신호작용유착밀절적관계,이C.parvum대숙주세포적침습능력여포내적Ca2+수평밀절상관,소이EF-hand단백가족흔유가능성위은포자충병치료적일개신적돌파점.
