高技术通讯
高技術通訊
고기술통신
HIGH TECHNOLOGY LETTERS
2008年
6期
650-656
,共7页
刘敏%王子峰%朱开玲%李洪波%高绪敏%邓兵%肖天
劉敏%王子峰%硃開玲%李洪波%高緒敏%鄧兵%肖天
류민%왕자봉%주개령%리홍파%고서민%산병%초천
细菌群落组成%16S rDNA序列分析%PCR-DGGE%长江口低氧区
細菌群落組成%16S rDNA序列分析%PCR-DGGE%長江口低氧區
세균군락조성%16S rDNA서렬분석%PCR-DGGE%장강구저양구
应用PCR结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.对25条DGGE条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16S rDNA基因V3区序列进行了系统进化分析.结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria).其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria和δ-Proteobacteria相似.时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria).并且8月份低氧水体中Flavobacteria为优势菌群.
應用PCR結閤變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)技術對長江口外低氧區的細菌群落組成和優勢菌群進行瞭分析.對25條DGGE條帶進行瞭剋隆、測序,所得到的細菌16S rDNA基因V3區序列進行瞭繫統進化分析.結果顯示這25條條帶分彆歸屬于4箇細菌類群:變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroides)、厚壁菌門(Firmicutes)和藍細菌門(Cyanobacteria).其中有16條分彆與變形細菌亞群的γ-Proteobacteria和δ-Proteobacteria相似.時空分析髮現,低氧水體的細菌群落組成與非低氧水體的組成不同,低氧水體包括變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroides)、厚壁菌門(Firmicutes)和藍細菌門(Cyanobacteria),非低氧水體中沒有髮現藍細菌門(Cyanobacteria).併且8月份低氧水體中Flavobacteria為優勢菌群.
응용PCR결합변성제도응효전영(PCR-DGGE)기술대장강구외저양구적세균군락조성화우세균군진행료분석.대25조DGGE조대진행료극륭、측서,소득도적세균16S rDNA기인V3구서렬진행료계통진화분석.결과현시저25조조대분별귀속우4개세균류군:변형균문(Proteobacteria)、의간균문(Bacteroides)、후벽균문(Firmicutes)화람세균문(Cyanobacteria).기중유16조분별여변형세균아군적γ-Proteobacteria화δ-Proteobacteria상사.시공분석발현,저양수체적세균군락조성여비저양수체적조성불동,저양수체포괄변형균문(Proteobacteria)、의간균문(Bacteroides)、후벽균문(Firmicutes)화람세균문(Cyanobacteria),비저양수체중몰유발현람세균문(Cyanobacteria).병차8월빈저양수체중Flavobacteria위우세균군.
