志贺氏菌属鲍氏(S. boydii)亚群基因组组成与进化分析
지하씨균속포씨(S. boydii)아군기인조조성여진화분석
  • 万方数据
    中国科学C辑 중국과학C집
    SCIENCE IN CHINA (SERIES C)
    2005年 4期 359-364 ,共6页

    张笑冰%王璟%彭俊平%杨娥%宾文%杨剑%董杰%孙立连%徐星晔%金奇

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    志贺菌属鲍氏亚群%比较基因组杂交%株特异性ORFs%进化 誌賀菌屬鮑氏亞群%比較基因組雜交%株特異性ORFs%進化
    지하균속포씨아군%비교기인조잡교%주특이성ORFs%진화
    利用比较基因组杂交法(comparative genomic hybridization, CGH)对志贺氏菌属鲍氏 (S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析, 结果显示, 该亚群基因组的"共有骨架"包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对K12基因组, 该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个, 主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因, 而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主, 一些参与铁离子代谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在.以比较基因组杂交法得到的进化分析显示: 鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组, 其中13型与其他菌株有较大的差异.这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系.通过对该亚群"共有骨架"、缺失基因和株特异基因, 以及进化分类等方面的分析, 以期探索该亚群基因组的进化规律, 并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.
    이용비교기인조잡교법(comparative genomic hybridization, CGH)대지하씨균속포씨 (S.boydii)아군공18개혈청형대표균주적기인조결구조성진행비교분석, 결과현시, 해아군기인조적"공유골가"포함2552개여비치병성대장간균K12동원적ORFs.비대K12기인조, 해아군소유균주기인조공동결실ORFs위199개, 주요섭급외막단백편마기인화O-항원합성상관기인, 이속우아군특이성적ORFs주요이서균체기인화미지공능ORFs위주, 일사삼여철리자대사、운수화Ⅱ형분비계통기인재대다수적포씨균주중존재.이비교기인조잡교법득도적진화분석현시: 포씨아군18개혈청형대표균주가분위4조, 기중13형여기타균주유교대적차이.저충분조결과여모사대사상관적기인분포정황존재대응관계.통과대해아군"공유골가"、결실기인화주특이기인, 이급진화분류등방면적분석, 이기탐색해아군기인조적진화규률, 병위지하씨균속포씨아군적치병궤리、역묘연제화약물개발등방면적연구제공중요선색.
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