动物学研究
動物學研究
동물학연구
ZOOLOGICAL RESEARCH
2007年
3期
271-278
,共8页
microRNA%miR-34%分子进化
microRNA%miR-34%分子進化
microRNA%miR-34%분자진화
根据miRNA基因在进化中高度保守的特点,利用生物信息学方法在目前已测序的动物物种中搜寻参与哺乳动物早期发育调控的mir-34基因的同源序列,在33个不同的动物物种中获得了miR-34基因的54条同源序列,其中18条为新发现的序列.表明miR-34是高度保守的,广泛存在于后生动物中.目前发现的mir-34基因80%位于基因间隔区,少数位于蛋白编码基因的内含子区和3'UTR上.不同动物中,mir-34基因成熟序列的同源性为68%,前体序列为38.89%.在无脊椎动物中只有一个mir-34,而在几乎所有的脊椎动物中都有mir-34a,mir-34b,mir-34c,形成miR-34基因家族.系统进化分析表明,脊椎动物中miR-34基因家族是通过基因的串联和局部重复形成的,这个过程中伴随着个别碱基的变异.
根據miRNA基因在進化中高度保守的特點,利用生物信息學方法在目前已測序的動物物種中搜尋參與哺乳動物早期髮育調控的mir-34基因的同源序列,在33箇不同的動物物種中穫得瞭miR-34基因的54條同源序列,其中18條為新髮現的序列.錶明miR-34是高度保守的,廣汎存在于後生動物中.目前髮現的mir-34基因80%位于基因間隔區,少數位于蛋白編碼基因的內含子區和3'UTR上.不同動物中,mir-34基因成熟序列的同源性為68%,前體序列為38.89%.在無脊椎動物中隻有一箇mir-34,而在幾乎所有的脊椎動物中都有mir-34a,mir-34b,mir-34c,形成miR-34基因傢族.繫統進化分析錶明,脊椎動物中miR-34基因傢族是通過基因的串聯和跼部重複形成的,這箇過程中伴隨著箇彆堿基的變異.
근거miRNA기인재진화중고도보수적특점,이용생물신식학방법재목전이측서적동물물충중수심삼여포유동물조기발육조공적mir-34기인적동원서렬,재33개불동적동물물충중획득료miR-34기인적54조동원서렬,기중18조위신발현적서렬.표명miR-34시고도보수적,엄범존재우후생동물중.목전발현적mir-34기인80%위우기인간격구,소수위우단백편마기인적내함자구화3'UTR상.불동동물중,mir-34기인성숙서렬적동원성위68%,전체서렬위38.89%.재무척추동물중지유일개mir-34,이재궤호소유적척추동물중도유mir-34a,mir-34b,mir-34c,형성miR-34기인가족.계통진화분석표명,척추동물중miR-34기인가족시통과기인적천련화국부중복형성적,저개과정중반수착개별감기적변이.
