物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2009年
3期
417-422
,共6页
赵勇山%郑清川%张红星%楚慧郢%孙家钟
趙勇山%鄭清川%張紅星%楚慧郢%孫傢鐘
조용산%정청천%장홍성%초혜영%손가종
人类丝氨酸消旋酶%分子动力学模拟%分子对接%同源模建
人類絲氨痠消鏇酶%分子動力學模擬%分子對接%同源模建
인류사안산소선매%분자동역학모의%분자대접%동원모건
利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类丝氨酸消旋酶(hSR)的三维结构,并利用profile-3D和procheck方法评估了模型的可靠性.在此基础上用分子对接程序(affinity)将多肽类抑制剂A和B分别与hSR进行对接,获得了其复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了此类抑制剂与hSR的具体结合方式,明确了hSR与此类抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基,为基于人类丝氨酸消旋酶三维结构的药物设计提供重要的参考信息.
利用同源模建和分子動力學模擬方法構建瞭人類絲氨痠消鏇酶(hSR)的三維結構,併利用profile-3D和procheck方法評估瞭模型的可靠性.在此基礎上用分子對接程序(affinity)將多肽類抑製劑A和B分彆與hSR進行對接,穫得瞭其複閤物結構的理論模型.通過配體與受體之間相互作用能和結構分析給齣瞭此類抑製劑與hSR的具體結閤方式,明確瞭hSR與此類抑製劑結閤時起重要作用的氨基痠殘基,為基于人類絲氨痠消鏇酶三維結構的藥物設計提供重要的參攷信息.
이용동원모건화분자동역학모의방법구건료인류사안산소선매(hSR)적삼유결구,병이용profile-3D화procheck방법평고료모형적가고성.재차기출상용분자대접정서(affinity)장다태류억제제A화B분별여hSR진행대접,획득료기복합물결구적이론모형.통과배체여수체지간상호작용능화결구분석급출료차류억제제여hSR적구체결합방식,명학료hSR여차류억제제결합시기중요작용적안기산잔기,위기우인류사안산소선매삼유결구적약물설계제공중요적삼고신식.
