中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
20期
140-147
,共8页
G蛋白偶联受体%斑马鱼%基因克隆%结构预测%组织表达
G蛋白偶聯受體%斑馬魚%基因剋隆%結構預測%組織錶達
G단백우련수체%반마어%기인극륭%결구예측%조직표체
为了探讨硬骨鱼的G蛋白偶联受体的结构和功能.本研究通过RACE技术结合斑马鱼基因组序列分析,鉴定了一个G蛋白偶联受体的编码基因,命名为DrGPCR.该基因全长2251bp,包括一个1170bp的开放阅读框,编码389个氨基酸的蛋白.用SMART程序对其氨基酸序列进行分析发现,该蛋白包含有7个跨膜结构域,暗示其为膜蛋白.利用BLAST算法搜索非冗余蛋白数据库发现,DrGPCR蛋白与无脊椎动物GPCR家族的FMRFamide受体以及高等脊椎动物的GPCR 139和GPCR142具有高度的氨基酸序列一致性,而且DrGPCR与人GPR139蛋白的三级结构模型具有高度的相似性.序列分析和结构特征都表明DrGPCR是GPCR蛋白家族的一个成员.用邻接法对DrGPCR与绿河豚不同亚族10个GCRP蛋白进行聚类分析发现,DrGPCR属于视紫质受体亚族.通过半定量RT-PCR技术对DrGPCR在斑马鱼各组织的表达进行分析,DrGPCR在脑和肝胰腺中有高水平表达,而在其他被检测的组织没有表达.因此,本研究报道了一个斑马鱼G蛋白偶联受体的编码基因,序列分析和组织表达的结果表明,DrGPCR可能在神经调节和免疫系统中发挥功能.
為瞭探討硬骨魚的G蛋白偶聯受體的結構和功能.本研究通過RACE技術結閤斑馬魚基因組序列分析,鑒定瞭一箇G蛋白偶聯受體的編碼基因,命名為DrGPCR.該基因全長2251bp,包括一箇1170bp的開放閱讀框,編碼389箇氨基痠的蛋白.用SMART程序對其氨基痠序列進行分析髮現,該蛋白包含有7箇跨膜結構域,暗示其為膜蛋白.利用BLAST算法搜索非冗餘蛋白數據庫髮現,DrGPCR蛋白與無脊椎動物GPCR傢族的FMRFamide受體以及高等脊椎動物的GPCR 139和GPCR142具有高度的氨基痠序列一緻性,而且DrGPCR與人GPR139蛋白的三級結構模型具有高度的相似性.序列分析和結構特徵都錶明DrGPCR是GPCR蛋白傢族的一箇成員.用鄰接法對DrGPCR與綠河豚不同亞族10箇GCRP蛋白進行聚類分析髮現,DrGPCR屬于視紫質受體亞族.通過半定量RT-PCR技術對DrGPCR在斑馬魚各組織的錶達進行分析,DrGPCR在腦和肝胰腺中有高水平錶達,而在其他被檢測的組織沒有錶達.因此,本研究報道瞭一箇斑馬魚G蛋白偶聯受體的編碼基因,序列分析和組織錶達的結果錶明,DrGPCR可能在神經調節和免疫繫統中髮揮功能.
위료탐토경골어적G단백우련수체적결구화공능.본연구통과RACE기술결합반마어기인조서렬분석,감정료일개G단백우련수체적편마기인,명명위DrGPCR.해기인전장2251bp,포괄일개1170bp적개방열독광,편마389개안기산적단백.용SMART정서대기안기산서렬진행분석발현,해단백포함유7개과막결구역,암시기위막단백.이용BLAST산법수색비용여단백수거고발현,DrGPCR단백여무척추동물GPCR가족적FMRFamide수체이급고등척추동물적GPCR 139화GPCR142구유고도적안기산서렬일치성,이차DrGPCR여인GPR139단백적삼급결구모형구유고도적상사성.서렬분석화결구특정도표명DrGPCR시GPCR단백가족적일개성원.용린접법대DrGPCR여록하돈불동아족10개GCRP단백진행취류분석발현,DrGPCR속우시자질수체아족.통과반정량RT-PCR기술대DrGPCR재반마어각조직적표체진행분석,DrGPCR재뇌화간이선중유고수평표체,이재기타피검측적조직몰유표체.인차,본연구보도료일개반마어G단백우련수체적편마기인,서렬분석화조직표체적결과표명,DrGPCR가능재신경조절화면역계통중발휘공능.
