生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2011年
7期
154-159
,共6页
谢夏青%李志勇%马继芳%刘磊%董志平%董金皋
謝夏青%李誌勇%馬繼芳%劉磊%董誌平%董金皋
사하청%리지용%마계방%류뢰%동지평%동금고
谷子弯孢病菌%海藻糖酶%基因克隆%染色体步移%生物信息学
穀子彎孢病菌%海藻糖酶%基因剋隆%染色體步移%生物信息學
곡자만포병균%해조당매%기인극륭%염색체보이%생물신식학
海藻糖代谢调控真菌生长、发育及致病性,为了进一步研究海藻糖代谢在谷子弯孢病菌中的功能,对海藻糖酶基因及其启动子进行了克隆.根据植物病原真菌海藻糖酶基因的保守序列设计简并引物,扩增得到海藻糖酶基因同源序列.通过RACE技术,首次在谷子弯孢病菌中克隆得到了海藻糖酶基因(ClTRE)全长cDNA序列.序列分析表明,该基因最大开放阅读框为2037 bp,编码679个氨基酸;二级结构预测表明,该蛋白含约40.48%的α螺旋,12.99%的延伸串,6.5%的β转角,40.03%的不规则卷曲;蛋白保守结构域分析发现其含有海藻糖酶特有的保守位点,与其他植物病原真菌中海藻糖酶基因有51%-86%同源性;利用SignalP3.0软件预测谷子弯孢海藻糖酶蛋白具有信号肽.通过染色体步移技术克隆得到其上游启动子序列,利用TFSEARCH软件分析含有多个与逆境胁迫相关的顺式作用元件,初步推测该基因与逆境胁迫相关.谷子弯孢病菌ClTRE基因及其启动子的克隆,为进一步研究该基因在病菌致病中作用以及以该基因为靶位点的化学防控奠定基础.
海藻糖代謝調控真菌生長、髮育及緻病性,為瞭進一步研究海藻糖代謝在穀子彎孢病菌中的功能,對海藻糖酶基因及其啟動子進行瞭剋隆.根據植物病原真菌海藻糖酶基因的保守序列設計簡併引物,擴增得到海藻糖酶基因同源序列.通過RACE技術,首次在穀子彎孢病菌中剋隆得到瞭海藻糖酶基因(ClTRE)全長cDNA序列.序列分析錶明,該基因最大開放閱讀框為2037 bp,編碼679箇氨基痠;二級結構預測錶明,該蛋白含約40.48%的α螺鏇,12.99%的延伸串,6.5%的β轉角,40.03%的不規則捲麯;蛋白保守結構域分析髮現其含有海藻糖酶特有的保守位點,與其他植物病原真菌中海藻糖酶基因有51%-86%同源性;利用SignalP3.0軟件預測穀子彎孢海藻糖酶蛋白具有信號肽.通過染色體步移技術剋隆得到其上遊啟動子序列,利用TFSEARCH軟件分析含有多箇與逆境脅迫相關的順式作用元件,初步推測該基因與逆境脅迫相關.穀子彎孢病菌ClTRE基因及其啟動子的剋隆,為進一步研究該基因在病菌緻病中作用以及以該基因為靶位點的化學防控奠定基礎.
해조당대사조공진균생장、발육급치병성,위료진일보연구해조당대사재곡자만포병균중적공능,대해조당매기인급기계동자진행료극륭.근거식물병원진균해조당매기인적보수서렬설계간병인물,확증득도해조당매기인동원서렬.통과RACE기술,수차재곡자만포병균중극륭득도료해조당매기인(ClTRE)전장cDNA서렬.서렬분석표명,해기인최대개방열독광위2037 bp,편마679개안기산;이급결구예측표명,해단백함약40.48%적α라선,12.99%적연신천,6.5%적β전각,40.03%적불규칙권곡;단백보수결구역분석발현기함유해조당매특유적보수위점,여기타식물병원진균중해조당매기인유51%-86%동원성;이용SignalP3.0연건예측곡자만포해조당매단백구유신호태.통과염색체보이기술극륭득도기상유계동자서렬,이용TFSEARCH연건분석함유다개여역경협박상관적순식작용원건,초보추측해기인여역경협박상관.곡자만포병균ClTRE기인급기계동자적극륭,위진일보연구해기인재병균치병중작용이급이해기인위파위점적화학방공전정기출.