热带亚热带植物学报
熱帶亞熱帶植物學報
열대아열대식물학보
JOURNAL OF TROPICAL AND SUBTROPICAL BOTANY
2010年
6期
665-669
,共5页
向闱%宁祖林%康明%黄宏文
嚮闈%寧祖林%康明%黃宏文
향위%저조림%강명%황굉문
中国板栗%EST-SSR%栗属%通用性
中國闆慄%EST-SSR%慄屬%通用性
중국판률%EST-SSR%률속%통용성
从已公布的壳斗科(Fagaceae)基因组数据库中获得48501条中国板栗(Castanea mollissima)EST序列,其中8479条EST含有12116个长度大于10 bp的SSR,EST-SSR的出现频率为24.98%.二核苷酸重复和三核苷酸重复是中国板栗EST-SSR最主要的重复类型,分别占总数的38.05%和42.20%.对中国板栗EST-SSR标记在茅栗(C.seguinii)和锥栗(C.henryi)的通用性检测表明,677对中国板栗EST-SSR引物皆能扩增,证实这些引物在栗属中国特有种间具有很高的通用性.115个位点的多态性分析表明,中国板栗、茅栗和锥栗分别有106、108和101个位点表现出多态性.在575个等位基因中,有260个(45.22%)是3物种的共有等位基因,各物种都有各自特有的等位基因.这项研究为中国栗属植物EST-SSR标记的建立及应用奠定了基础.
從已公佈的殼鬥科(Fagaceae)基因組數據庫中穫得48501條中國闆慄(Castanea mollissima)EST序列,其中8479條EST含有12116箇長度大于10 bp的SSR,EST-SSR的齣現頻率為24.98%.二覈苷痠重複和三覈苷痠重複是中國闆慄EST-SSR最主要的重複類型,分彆佔總數的38.05%和42.20%.對中國闆慄EST-SSR標記在茅慄(C.seguinii)和錐慄(C.henryi)的通用性檢測錶明,677對中國闆慄EST-SSR引物皆能擴增,證實這些引物在慄屬中國特有種間具有很高的通用性.115箇位點的多態性分析錶明,中國闆慄、茅慄和錐慄分彆有106、108和101箇位點錶現齣多態性.在575箇等位基因中,有260箇(45.22%)是3物種的共有等位基因,各物種都有各自特有的等位基因.這項研究為中國慄屬植物EST-SSR標記的建立及應用奠定瞭基礎.
종이공포적각두과(Fagaceae)기인조수거고중획득48501조중국판률(Castanea mollissima)EST서렬,기중8479조EST함유12116개장도대우10 bp적SSR,EST-SSR적출현빈솔위24.98%.이핵감산중복화삼핵감산중복시중국판률EST-SSR최주요적중복류형,분별점총수적38.05%화42.20%.대중국판률EST-SSR표기재모률(C.seguinii)화추률(C.henryi)적통용성검측표명,677대중국판률EST-SSR인물개능확증,증실저사인물재률속중국특유충간구유흔고적통용성.115개위점적다태성분석표명,중국판률、모률화추률분별유106、108화101개위점표현출다태성.재575개등위기인중,유260개(45.22%)시3물충적공유등위기인,각물충도유각자특유적등위기인.저항연구위중국률속식물EST-SSR표기적건립급응용전정료기출.
