CAJ | 학술논문

目的:应用基因表达谱芯片筛选胃癌正常胃黏膜、胃癌原发灶和淋巴结转移灶的差异表达基因,并结合生物信息学方法筛选胃癌淋巴结转移相关基因,探讨TLNI与胃癌淋巴结转移的关系.方法:应用Affy-metrix芯片筛选癌旁正常胃黏膜(A组)、胃癌原发灶(B组)和淋巴结转移灶(C组)的差异表达基因,利用队列试验的基因表达谱分析、基于聚类分析结果的基因功能(基于Gene Ontology分类)集群分析和Pathway分析等生物信息学方法对结果进行分析,并用RT-PCR检测TLNl在胃癌原发灶和淋巴结转移灶的表达情况.结果:A、B、C 3组呈连续上调的差异表达基因278个,其功能主要集中在免疫应答、细胞黏附、磷酸盐转运、阴离子转移、细胞趋化和移动、信号转导等方面;连续下调的387个基因其功能主要集中在消化、糖类代谢、脂质代谢、蛋白代谢、一氧化氮复合物代谢、一氧化碳复合物代谢、细胞黏附等方面.Pathway分析显示在整合素介导的细胞黏附信号通路异常激活,THBS12、TLN1、CAPN3、ITGAX、SORBS1、CAPN6、CAPN9在3组中呈连续梯度改变.TLN1在癌旁非肿瘤胃黏膜、胃癌原发灶和淋巴结转移灶表达量分别为:0.0000342±0.0000711、0.1064±0.1251和0.2886±0.3529;在胃癌淋巴结转移灶显著高表达(P<0.05).结论:基因芯片技术结合生物信息学方法筛选胃癌淋巴转移相关基因,有助于找到胃癌淋巴道转移的关键基因或通路,为寻找肿瘤淋巴道转移的早期诊断指标及新的治疗靶点奠定了实验基础,本研究结果初步表明在整合素信号通路中扮演重要角色的TLN1基因异常表达与胃癌淋巴结转移密切相关.
목적:응용기인표체보심편사선위암정상위점막、위암원발조화림파결전이조적차이표체기인,병결합생물신식학방법사선위암림파결전이상관기인,탐토TLNI여위암림파결전이적관계.방법:응용Affy-metrix심편사선암방정상위점막(A조)、위암원발조(B조)화림파결전이조(C조)적차이표체기인,이용대렬시험적기인표체보분석、기우취류분석결과적기인공능(기우Gene Ontology분류)집군분석화Pathway분석등생물신식학방법대결과진행분석,병용RT-PCR검측TLNl재위암원발조화림파결전이조적표체정황.결과:A、B、C 3조정련속상조적차이표체기인278개,기공능주요집중재면역응답、세포점부、린산염전운、음리자전이、세포추화화이동、신호전도등방면;련속하조적387개기인기공능주요집중재소화、당류대사、지질대사、단백대사、일양화담복합물대사、일양화탄복합물대사、세포점부등방면.Pathway분석현시재정합소개도적세포점부신호통로이상격활,THBS12、TLN1、CAPN3、ITGAX、SORBS1、CAPN6、CAPN9재3조중정련속제도개변.TLN1재암방비종류위점막、위암원발조화림파결전이조표체량분별위:0.0000342±0.0000711、0.1064±0.1251화0.2886±0.3529;재위암림파결전이조현저고표체(P<0.05).결론:기인심편기술결합생물신식학방법사선위암림파전이상관기인,유조우조도위암림파도전이적관건기인혹통로,위심조종류림파도전이적조기진단지표급신적치료파점전정료실험기출,본연구결과초보표명재정합소신호통로중분연중요각색적TLN1기인이상표체여위암림파결전이밀절상관.