人cDNA序列中二类甲硫氨酸密码子的区分
인cDNA서렬중이류갑류안산밀마자적구분
Recognition Analysis of Two Kinds of Methionine Codons in Human cDNA Sequences
  • 万方数据
    复旦学报（自然科学版） 복단학보（자연과학판）
    JOURNAL OF FUDAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
    2000年 6期 675-679 ,共5页

    付旭平%戴建凉%田立峰%黄达蔷%沈健民%吕军%谢毅%毛裕民

    부욱평%대건량%전립봉%황체장%침건민%려군%사의%모유민

    起始密码子%甲硫氨酸密码子%位置权重矩阵%Z曲线%费歇判别 起始密碼子%甲硫氨痠密碼子%位置權重矩陣%Z麯線%費歇判彆
    기시밀마자%갑류안산밀마자%위치권중구진%Z곡선%비헐판별
    在人类cDNA序列确定全长基因的过程中,必须判断第一个ATG密码子是真正的起始密码子还是框内的非起始作用的甲硫氨酸密码子.在总结了这二类密码子上下文共有序列特征、周期性、密码子的碱基偏向性、以及编码的氨基酸的疏水性等方面差异的基础上,从模式识别的角度出发,将这二类密码子视为由此构成的多维特征空间中的二个模式类,应用费歇线性判别法进行分类器的设计,并对分类器的错误率进行估计,表明在这些特征下,这二类密码子可以区分.以此分类器的标准判断真正的起始密码子和非起始甲硫氨酸密码子,其准确率可达75%.
    재인류cDNA서렬학정전장기인적과정중,필수판단제일개ATG밀마자시진정적기시밀마자환시광내적비기시작용적갑류안산밀마자.재총결료저이류밀마자상하문공유서렬특정、주기성、밀마자적감기편향성、이급편마적안기산적소수성등방면차이적기출상,종모식식별적각도출발,장저이류밀마자시위유차구성적다유특정공간중적이개모식류,응용비헐선성판별법진행분류기적설계,병대분류기적착오솔진행고계,표명재저사특정하,저이류밀마자가이구분.이차분류기적표준판단진정적기시밀마자화비기시갑류안산밀마자,기준학솔가체75%.
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