微生物学通报
微生物學通報
미생물학통보
MICROBIOLOGY
2008年
9期
1359-1366
,共8页
董晓毅%王梁华%孙铭娟%宗英%焦豫良%焦炳华
董曉毅%王樑華%孫銘娟%宗英%焦豫良%焦炳華
동효의%왕량화%손명연%종영%초예량%초병화
未获得培养微生物%聚酮合酶%酮缩合酶%土壤%海水
未穫得培養微生物%聚酮閤酶%酮縮閤酶%土壤%海水
미획득배양미생물%취동합매%동축합매%토양%해수
为考察土壤和海水中Ⅰ型聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因的多样性和差异,本研究自行设计了一套针对PKS基因中酮缩合酶(ketosynthase,KS)片段的简并引物,使用PCR方法直接克隆东海洋山港沿岸土壤和海水DNA样本中的KS片段,去除重复序列后,共获得了23条不同的KS片段(长度为630 bp～690 bp),提交GenBank皆获登录号,其中19条来自土壤(DQ640993,DQ640997、DQ641926、DQ641927、DQ673137～DQ673151),4条来自海水(DQ673151,EF554859～EF554861),由核苷酸序列推断出的氨基酸序列保守,与GenBank中已知KS基因片段的相似度在45%到85%之间,种系发生分析表明,其中14条KS片段(来源于海水的KS片段皆在其中)应来源于典型的KS群,而剩余9条则来源于杂合的PKSmRPS(Non-ribosomalpeptide synthetase.非核糖体多肽合成酶)群.另外,几条KS基因特征明显,可用于进一步的研究.
為攷察土壤和海水中Ⅰ型聚酮閤酶(polyketide synthase,PKS)基因的多樣性和差異,本研究自行設計瞭一套針對PKS基因中酮縮閤酶(ketosynthase,KS)片段的簡併引物,使用PCR方法直接剋隆東海洋山港沿岸土壤和海水DNA樣本中的KS片段,去除重複序列後,共穫得瞭23條不同的KS片段(長度為630 bp～690 bp),提交GenBank皆穫登錄號,其中19條來自土壤(DQ640993,DQ640997、DQ641926、DQ641927、DQ673137～DQ673151),4條來自海水(DQ673151,EF554859～EF554861),由覈苷痠序列推斷齣的氨基痠序列保守,與GenBank中已知KS基因片段的相似度在45%到85%之間,種繫髮生分析錶明,其中14條KS片段(來源于海水的KS片段皆在其中)應來源于典型的KS群,而剩餘9條則來源于雜閤的PKSmRPS(Non-ribosomalpeptide synthetase.非覈糖體多肽閤成酶)群.另外,幾條KS基因特徵明顯,可用于進一步的研究.
위고찰토양화해수중Ⅰ형취동합매(polyketide synthase,PKS)기인적다양성화차이,본연구자행설계료일투침대PKS기인중동축합매(ketosynthase,KS)편단적간병인물,사용PCR방법직접극륭동해양산항연안토양화해수DNA양본중적KS편단,거제중복서렬후,공획득료23조불동적KS편단(장도위630 bp～690 bp),제교GenBank개획등록호,기중19조래자토양(DQ640993,DQ640997、DQ641926、DQ641927、DQ673137～DQ673151),4조래자해수(DQ673151,EF554859～EF554861),유핵감산서렬추단출적안기산서렬보수,여GenBank중이지KS기인편단적상사도재45%도85%지간,충계발생분석표명,기중14조KS편단(래원우해수적KS편단개재기중)응래원우전형적KS군,이잉여9조칙래원우잡합적PKSmRPS(Non-ribosomalpeptide synthetase.비핵당체다태합성매)군.령외,궤조KS기인특정명현,가용우진일보적연구.
