广西农业生物科学
廣西農業生物科學
엄서농업생물과학
JOURNAL OF GUANGXI AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL SCIENCE
2008年
4期
372-377
,共6页
蒋建林%周权能%车志群%邓珍琴%武波
蔣建林%週權能%車誌群%鄧珍琴%武波
장건림%주권능%차지군%산진금%무파
沼气池%16SrDNA%PCR-RFLP%细菌多样性
沼氣池%16SrDNA%PCR-RFLP%細菌多樣性
소기지%16SrDNA%PCR-RFLP%세균다양성
应用PCR-RFLP和rRNA分析法研究了户用沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性.采用直接提取法提取了户用沼气池微生物宏基因组DNA,构建了细菌的l6S rDNA克隆文库.随机挑取了144个准确含有16S rDNA的阳性克隆进行PCR-RFLP分析,聚类得到46个OTUs(operational taxonomic units),其中3个OTUs是优势类群,分别占14%,10%和9%,21个OTUs只含有单个克隆.随机挑取了26个克隆进行测序,并构建了系统发育进化树.结果表明:农村户用沼气池中细菌种类较为丰富,占优势的类群分别为Firmicutes(28%)、Delta-proteobacteria(18%)和Bacteroidetes(17%),大多数16S rDNA序列与GenBank数据库中未培养细菌相似性最高(91%～99%),为进一步研究、利用沼气池能源提供了基础资料.
應用PCR-RFLP和rRNA分析法研究瞭戶用沼氣池厭氧活性汙泥細菌的多樣性.採用直接提取法提取瞭戶用沼氣池微生物宏基因組DNA,構建瞭細菌的l6S rDNA剋隆文庫.隨機挑取瞭144箇準確含有16S rDNA的暘性剋隆進行PCR-RFLP分析,聚類得到46箇OTUs(operational taxonomic units),其中3箇OTUs是優勢類群,分彆佔14%,10%和9%,21箇OTUs隻含有單箇剋隆.隨機挑取瞭26箇剋隆進行測序,併構建瞭繫統髮育進化樹.結果錶明:農村戶用沼氣池中細菌種類較為豐富,佔優勢的類群分彆為Firmicutes(28%)、Delta-proteobacteria(18%)和Bacteroidetes(17%),大多數16S rDNA序列與GenBank數據庫中未培養細菌相似性最高(91%～99%),為進一步研究、利用沼氣池能源提供瞭基礎資料.
응용PCR-RFLP화rRNA분석법연구료호용소기지염양활성오니세균적다양성.채용직접제취법제취료호용소기지미생물굉기인조DNA,구건료세균적l6S rDNA극륭문고.수궤도취료144개준학함유16S rDNA적양성극륭진행PCR-RFLP분석,취류득도46개OTUs(operational taxonomic units),기중3개OTUs시우세류군,분별점14%,10%화9%,21개OTUs지함유단개극륭.수궤도취료26개극륭진행측서,병구건료계통발육진화수.결과표명:농촌호용소기지중세균충류교위봉부,점우세적류군분별위Firmicutes(28%)、Delta-proteobacteria(18%)화Bacteroidetes(17%),대다수16S rDNA서렬여GenBank수거고중미배양세균상사성최고(91%～99%),위진일보연구、이용소기지능원제공료기출자료.
