计算机研究与发展
計算機研究與髮展
계산궤연구여발전
JOURNAL OF COMPUTER RESEARCH AND DEVELOPMENT
2012年
4期
812-817
,共6页
董浩%刘元宁%张浩%王刚
董浩%劉元寧%張浩%王剛
동호%류원저%장호%왕강
生物信息学%RNA二级结构%假结%自由能%隐Markov模型(HMM)
生物信息學%RNA二級結構%假結%自由能%隱Markov模型(HMM)
생물신식학%RNA이급결구%가결%자유능%은Markov모형(HMM)
有效预测RNA二级结构是生物信息学中的重要研究领域.提出一种基于隐Markov模型预测RNA二级结构的新方法.首先,应用前后缀匹配算法快速找到所有可能(包括假结)的茎区,建立RNA-HMM,寻找最优的茎区组合方法,得到包含假结的RNA二级结构.实验结果表明,提出的新方法降低了计算复杂性,提高了预测的特异性和敏感性,具有较高的准确率,可以预测RNA的假结结构.
有效預測RNA二級結構是生物信息學中的重要研究領域.提齣一種基于隱Markov模型預測RNA二級結構的新方法.首先,應用前後綴匹配算法快速找到所有可能(包括假結)的莖區,建立RNA-HMM,尋找最優的莖區組閤方法,得到包含假結的RNA二級結構.實驗結果錶明,提齣的新方法降低瞭計算複雜性,提高瞭預測的特異性和敏感性,具有較高的準確率,可以預測RNA的假結結構.
유효예측RNA이급결구시생물신식학중적중요연구영역.제출일충기우은Markov모형예측RNA이급결구적신방법.수선,응용전후철필배산법쾌속조도소유가능(포괄가결)적경구,건립RNA-HMM,심조최우적경구조합방법,득도포함가결적RNA이급결구.실험결과표명,제출적신방법강저료계산복잡성,제고료예측적특이성화민감성,구유교고적준학솔,가이예측RNA적가결결구.
