微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2002年
2期
133-137
,共5页
曾静%窦岳坦%王磊%杨苏声
曾靜%竇嶽坦%王磊%楊囌聲
증정%두악탄%왕뢰%양소성
新疆地区,16S rDNA全序列,DNA-DNA杂交,系统发育
新疆地區,16S rDNA全序列,DNA-DNA雜交,繫統髮育
신강지구,16S rDNA전서렬,DNA-DNA잡교,계통발육
通过数值分类和16S rDNA PCR-RFLP分析,对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究,发现了一个新类群.在此基础上,进行了中心株AI-3的16S rDNA全序列分析,并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较,得到系统发育树状图.在此树状图中,大多数参比菌株聚在一起,其16S rDNA全序列的同源性在96%以上,而AI-3与参比菌株的16S rDNA全序列相比,其相似性低于75%.但是,AI-3与Alcanivorax borkumensis[1]的16S rDNA全序列的相似性为96%,与Halobacilluslitoralis的16S rDNA全序列的相似性为99%,三者构成一个独立的发育分支.这说明在系统发育上,AI-3与参比菌株属于不同的分支,是一个新的类群.在新类群内,菌株之间的DNA同源性大于70%,而中心株AI-3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)的DNA同源性为44%,表明新分离的菌株可能构成一个新种群.
通過數值分類和16S rDNA PCR-RFLP分析,對分離自新疆地區的中度嗜鹽革蘭氏陰性菌進行研究,髮現瞭一箇新類群.在此基礎上,進行瞭中心株AI-3的16S rDNA全序列分析,併與中度嗜鹽菌已知種和相關種進行比較,得到繫統髮育樹狀圖.在此樹狀圖中,大多數參比菌株聚在一起,其16S rDNA全序列的同源性在96%以上,而AI-3與參比菌株的16S rDNA全序列相比,其相似性低于75%.但是,AI-3與Alcanivorax borkumensis[1]的16S rDNA全序列的相似性為96%,與Halobacilluslitoralis的16S rDNA全序列的相似性為99%,三者構成一箇獨立的髮育分支.這說明在繫統髮育上,AI-3與參比菌株屬于不同的分支,是一箇新的類群.在新類群內,菌株之間的DNA同源性大于70%,而中心株AI-3與標準菌株伸長鹽單胞菌(Halomonas elongata)的DNA同源性為44%,錶明新分離的菌株可能構成一箇新種群.
통과수치분류화16S rDNA PCR-RFLP분석,대분리자신강지구적중도기염혁란씨음성균진행연구,발현료일개신류군.재차기출상,진행료중심주AI-3적16S rDNA전서렬분석,병여중도기염균이지충화상관충진행비교,득도계통발육수상도.재차수상도중,대다수삼비균주취재일기,기16S rDNA전서렬적동원성재96%이상,이AI-3여삼비균주적16S rDNA전서렬상비,기상사성저우75%.단시,AI-3여Alcanivorax borkumensis[1]적16S rDNA전서렬적상사성위96%,여Halobacilluslitoralis적16S rDNA전서렬적상사성위99%,삼자구성일개독립적발육분지.저설명재계통발육상,AI-3여삼비균주속우불동적분지,시일개신적류군.재신류군내,균주지간적DNA동원성대우70%,이중심주AI-3여표준균주신장염단포균(Halomonas elongata)적DNA동원성위44%,표명신분리적균주가능구성일개신충군.
