生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
3期
206-209
,共4页
蛋白质二级结构预测方法%内在评价%外在评价
蛋白質二級結構預測方法%內在評價%外在評價
단백질이급결구예측방법%내재평개%외재평개
目前评价蛋白质二级结构预测方法主要考虑预测准确率,并没有充分考虑方法自身参数对方法的影响.本文提出一种新型评价方法,将内在评价与外在评价相结合评价预测方法的优劣.以基于混合并行遗传算法的蛋白质二级结构预测方法为例,通过内在评价,合理选取内在参数--切片长度和组内类别数,有效提高预测准确率,同时,通过外在评价,与其他基于随机算法的蛋白质二级结构预测算法比较和与CASP所提供的结论比较,说明了方法的有效性与正确性,以此验证内在评价和外在评价的客观性、公正性和全面性.
目前評價蛋白質二級結構預測方法主要攷慮預測準確率,併沒有充分攷慮方法自身參數對方法的影響.本文提齣一種新型評價方法,將內在評價與外在評價相結閤評價預測方法的優劣.以基于混閤併行遺傳算法的蛋白質二級結構預測方法為例,通過內在評價,閤理選取內在參數--切片長度和組內類彆數,有效提高預測準確率,同時,通過外在評價,與其他基于隨機算法的蛋白質二級結構預測算法比較和與CASP所提供的結論比較,說明瞭方法的有效性與正確性,以此驗證內在評價和外在評價的客觀性、公正性和全麵性.
목전평개단백질이급결구예측방법주요고필예측준학솔,병몰유충분고필방법자신삼수대방법적영향.본문제출일충신형평개방법,장내재평개여외재평개상결합평개예측방법적우렬.이기우혼합병행유전산법적단백질이급결구예측방법위례,통과내재평개,합리선취내재삼수--절편장도화조내유별수,유효제고예측준학솔,동시,통과외재평개,여기타기우수궤산법적단백질이급결구예측산법비교화여CASP소제공적결론비교,설명료방법적유효성여정학성,이차험증내재평개화외재평개적객관성、공정성화전면성.
