海洋学报(中文版)
海洋學報(中文版)
해양학보(중문판)
ACTA OCEANOLOGICA SINICA
2011年
5期
124-132
,共9页
厚蟹属%仿厚蟹属%线粒体DNA%16S rRNA基因%系统发育
厚蟹屬%倣厚蟹屬%線粒體DNA%16S rRNA基因%繫統髮育
후해속%방후해속%선립체DNA%16S rRNA기인%계통발육
对我国沿海天津厚蟹6个群体、侧足厚蟹4个群体、伍氏仿厚蟹2个群体和日本仿厚蟹1个群体的线粒体16S rRNA基因片段进行了序列测定;结合从GenBank下载的其他厚蟹序列,分析了厚蟹分子系统发育关系.除天津厚蟹丹东群体的2个个体16S rRNA基因片段长度为526 bp外,其他天津厚蟹和侧足厚蟹均为525 bp;除日照群体和丹东群体外,其他每个群体的个体之间没有序列差异,天津厚蟹和侧足厚蟹共有5个单倍型.伍氏仿厚蟹16S rRNA基因片段长度均为525 bp,群体、个体之间均无序列差异.日本仿厚蟹16S rRNA基因片段长度均为523 bp,个体之间无序列差异.其A,T,G,C含量只有略微的差异,A+T含量(72.3%~73.7%)明显高于G+C含量.4种厚蟹所有序列比对,在526 bp序列上共有变异位点36处和4处插入/缺失,其中简约信息位点26处,转换/颠换的平均值为2.8.在5个单倍型中,侧足厚蟹泉州、宁波群体的6个个体与天津厚蟹宁波、日照群体的4个个体的序列都相同,共享1个单倍型;而且5个单倍型之间的遗传距离很小,仅为0.19%~1.15%,表明二者为同一物种的不同形态类型.采用NJ法,ML法和MP法构建的厚蟹/张口蟹复合群系统进化树的拓扑结构基本一致.结果显示,天津厚蟹和侧足厚蟹的10个群体的5个单倍型和台湾厚蟹首先聚到一起,形成侧足厚蟹复合体后,再与三齿厚蟹聚为一支;日本仿厚蟹与德氏仿厚蟹先聚在一起,然后再与伍氏仿厚蟹聚为一支;均得到99%置信度的支持,表明厚蟹属蟹类和仿厚蟹属蟹类均为单系,支持将厚蟹亚属和仿厚蟹亚属分别提升为属.分子数据及系统树的拓扑结构亦支持将假厚蟹亚属和拟厚蟹亚属分别提升为属,以及形态学上将厚蟹/张口蟹复合群分为7个属的结论.
對我國沿海天津厚蟹6箇群體、側足厚蟹4箇群體、伍氏倣厚蟹2箇群體和日本倣厚蟹1箇群體的線粒體16S rRNA基因片段進行瞭序列測定;結閤從GenBank下載的其他厚蟹序列,分析瞭厚蟹分子繫統髮育關繫.除天津厚蟹丹東群體的2箇箇體16S rRNA基因片段長度為526 bp外,其他天津厚蟹和側足厚蟹均為525 bp;除日照群體和丹東群體外,其他每箇群體的箇體之間沒有序列差異,天津厚蟹和側足厚蟹共有5箇單倍型.伍氏倣厚蟹16S rRNA基因片段長度均為525 bp,群體、箇體之間均無序列差異.日本倣厚蟹16S rRNA基因片段長度均為523 bp,箇體之間無序列差異.其A,T,G,C含量隻有略微的差異,A+T含量(72.3%~73.7%)明顯高于G+C含量.4種厚蟹所有序列比對,在526 bp序列上共有變異位點36處和4處插入/缺失,其中簡約信息位點26處,轉換/顛換的平均值為2.8.在5箇單倍型中,側足厚蟹泉州、寧波群體的6箇箇體與天津厚蟹寧波、日照群體的4箇箇體的序列都相同,共享1箇單倍型;而且5箇單倍型之間的遺傳距離很小,僅為0.19%~1.15%,錶明二者為同一物種的不同形態類型.採用NJ法,ML法和MP法構建的厚蟹/張口蟹複閤群繫統進化樹的拓撲結構基本一緻.結果顯示,天津厚蟹和側足厚蟹的10箇群體的5箇單倍型和檯灣厚蟹首先聚到一起,形成側足厚蟹複閤體後,再與三齒厚蟹聚為一支;日本倣厚蟹與德氏倣厚蟹先聚在一起,然後再與伍氏倣厚蟹聚為一支;均得到99%置信度的支持,錶明厚蟹屬蟹類和倣厚蟹屬蟹類均為單繫,支持將厚蟹亞屬和倣厚蟹亞屬分彆提升為屬.分子數據及繫統樹的拓撲結構亦支持將假厚蟹亞屬和擬厚蟹亞屬分彆提升為屬,以及形態學上將厚蟹/張口蟹複閤群分為7箇屬的結論.
대아국연해천진후해6개군체、측족후해4개군체、오씨방후해2개군체화일본방후해1개군체적선립체16S rRNA기인편단진행료서렬측정;결합종GenBank하재적기타후해서렬,분석료후해분자계통발육관계.제천진후해단동군체적2개개체16S rRNA기인편단장도위526 bp외,기타천진후해화측족후해균위525 bp;제일조군체화단동군체외,기타매개군체적개체지간몰유서렬차이,천진후해화측족후해공유5개단배형.오씨방후해16S rRNA기인편단장도균위525 bp,군체、개체지간균무서렬차이.일본방후해16S rRNA기인편단장도균위523 bp,개체지간무서렬차이.기A,T,G,C함량지유략미적차이,A+T함량(72.3%~73.7%)명현고우G+C함량.4충후해소유서렬비대,재526 bp서렬상공유변이위점36처화4처삽입/결실,기중간약신식위점26처,전환/전환적평균치위2.8.재5개단배형중,측족후해천주、저파군체적6개개체여천진후해저파、일조군체적4개개체적서렬도상동,공향1개단배형;이차5개단배형지간적유전거리흔소,부위0.19%~1.15%,표명이자위동일물충적불동형태류형.채용NJ법,ML법화MP법구건적후해/장구해복합군계통진화수적탁복결구기본일치.결과현시,천진후해화측족후해적10개군체적5개단배형화태만후해수선취도일기,형성측족후해복합체후,재여삼치후해취위일지;일본방후해여덕씨방후해선취재일기,연후재여오씨방후해취위일지;균득도99%치신도적지지,표명후해속해류화방후해속해류균위단계,지지장후해아속화방후해아속분별제승위속.분자수거급계통수적탁복결구역지지장가후해아속화의후해아속분별제승위속,이급형태학상장후해/장구해복합군분위7개속적결론.