安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
7期
3884-3888
,共5页
尚明保%杨旬旬%吴风瑞%丁彪%刘勇%李文雍
尚明保%楊旬旬%吳風瑞%丁彪%劉勇%李文雍
상명보%양순순%오풍서%정표%류용%리문옹
组蛋白甲基化酶%MLL3%SET结构域%生物信息学
組蛋白甲基化酶%MLL3%SET結構域%生物信息學
조단백갑기화매%MLL3%SET결구역%생물신식학
[目的]对动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3进行生物信息学分析.[方法]利用生物信息学的方法,对小鼠MLL3的基因结构、氨基酸序列、系统进化树、染色体定位和共线性等问题进行分析.[结果]编码合成的小鼠MLL3蛋白质一级结构包括7个锌指结构域、1个HMG-box(高迁移率族蛋白)、1个FYRN(N-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个FYRC(C-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个SET域和1个postSET域;从序列对比和同源性上发现,该研究中的19种动物都基本上具有这些结构,说明这些结构在进化上是相对保守的,其中SET域具有高度的保守性,是维持组蛋白甲基化酶活性所必须的;从系统发生上看,19种动物在进化树上的位置与其分类地位相一致;在共线性分析中,虽然小鼠和人的MLL3基因位于不同的染色体上,但其上游和下游具有相同的基因,说明小鼠和人的MLL3基因具有共线性.[结论]不仅揭示了MLL3的核苷酸序列及其氨基酸序列的一级结构,为以后研究其高级结构和蛋白质的功能奠定了基础;同时也为后期进行小鼠MLL3基因的引物设计、启动子分析、基因的克隆、定位和表达的调控模式研究奠定了基础.
[目的]對動物組蛋白H3K4三甲基化轉移酶MLL3進行生物信息學分析.[方法]利用生物信息學的方法,對小鼠MLL3的基因結構、氨基痠序列、繫統進化樹、染色體定位和共線性等問題進行分析.[結果]編碼閤成的小鼠MLL3蛋白質一級結構包括7箇鋅指結構域、1箇HMG-box(高遷移率族蛋白)、1箇FYRN(N-末耑富含苯丙氨痠或酪氨痠區域)、1箇FYRC(C-末耑富含苯丙氨痠或酪氨痠區域)、1箇SET域和1箇postSET域;從序列對比和同源性上髮現,該研究中的19種動物都基本上具有這些結構,說明這些結構在進化上是相對保守的,其中SET域具有高度的保守性,是維持組蛋白甲基化酶活性所必鬚的;從繫統髮生上看,19種動物在進化樹上的位置與其分類地位相一緻;在共線性分析中,雖然小鼠和人的MLL3基因位于不同的染色體上,但其上遊和下遊具有相同的基因,說明小鼠和人的MLL3基因具有共線性.[結論]不僅揭示瞭MLL3的覈苷痠序列及其氨基痠序列的一級結構,為以後研究其高級結構和蛋白質的功能奠定瞭基礎;同時也為後期進行小鼠MLL3基因的引物設計、啟動子分析、基因的剋隆、定位和錶達的調控模式研究奠定瞭基礎.
[목적]대동물조단백H3K4삼갑기화전이매MLL3진행생물신식학분석.[방법]이용생물신식학적방법,대소서MLL3적기인결구、안기산서렬、계통진화수、염색체정위화공선성등문제진행분석.[결과]편마합성적소서MLL3단백질일급결구포괄7개자지결구역、1개HMG-box(고천이솔족단백)、1개FYRN(N-말단부함분병안산혹락안산구역)、1개FYRC(C-말단부함분병안산혹락안산구역)、1개SET역화1개postSET역;종서렬대비화동원성상발현,해연구중적19충동물도기본상구유저사결구,설명저사결구재진화상시상대보수적,기중SET역구유고도적보수성,시유지조단백갑기화매활성소필수적;종계통발생상간,19충동물재진화수상적위치여기분류지위상일치;재공선성분석중,수연소서화인적MLL3기인위우불동적염색체상,단기상유화하유구유상동적기인,설명소서화인적MLL3기인구유공선성.[결론]불부게시료MLL3적핵감산서렬급기안기산서렬적일급결구,위이후연구기고급결구화단백질적공능전정료기출;동시야위후기진행소서MLL3기인적인물설계、계동자분석、기인적극륭、정위화표체적조공모식연구전정료기출.