CAJ | 학술논문

高密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的出现和基因分型技术平台的发展使在猪上开展全基因组关联分析(GWAS)研究成为现实.本研究以大白猪(Sus scrofa)×民猪(S.scrofa)F2设计资源群体为研究对象,采用Illumina公司猪SNP60K分型芯片技术,开展胴体瘦肉量(LMW)GWAS研究,寻找与瘦肉量相关的遗传变异.所有F2代个体在达到(240±7)d日龄时进行屠宰测定.对分型后的355头F2个体,采用基于混合模型及回归的快速全基因组关联及基因组控制法(GRAMMAR-GC)方法进行GWAS分析,结果获得14个在染色体水平与瘦肉量性状显著关联的SNP位点(P＜9.63e-06,SSC1；P＜2.37e-05,SSC2; P＜1.56e-05,SSC14).其中2个SNP位点ALGA0010777和ALGA0010788分别位于1号染色体上285 030 256和285 276 856 bp处；10个SNP位点都位于猪2号染色体末端,可能与已发现的瘦肉量基因突变位点IGF2-intron3-G3072A紧密连锁；2个SNP位点ASGA0065444和ASGA0065455位于14号染色体上99 627 980和100 078 535 bp处.本研究为猪的瘦肉量性状提供了显著关联SNP位点,预测了新的候选基因.初步阐释了中外猪种瘦肉量性状巨大差异的分子机制,为进一步开展分子育种工作提供了基础研究资料.
고밀도단핵감산다태성(SNP)심편적출현화기인분형기술평태적발전사재저상개전전기인조관련분석(GWAS)연구성위현실.본연구이대백저(Sus scrofa)×민저(S.scrofa)F2설계자원군체위연구대상,채용Illumina공사저SNP60K분형심편기술,개전동체수육량(LMW)GWAS연구,심조여수육량상관적유전변이.소유F2대개체재체도(240±7)d일령시진행도재측정.대분형후적355두F2개체,채용기우혼합모형급회귀적쾌속전기인조관련급기인조공제법(GRAMMAR-GC)방법진행GWAS분석,결과획득14개재염색체수평여수육량성상현저관련적SNP위점(P＜9.63e-06,SSC1；P＜2.37e-05,SSC2; P＜1.56e-05,SSC14).기중2개SNP위점ALGA0010777화ALGA0010788분별위우1호염색체상285 030 256화285 276 856 bp처；10개SNP위점도위우저2호염색체말단,가능여이발현적수육량기인돌변위점IGF2-intron3-G3072A긴밀련쇄；2개SNP위점ASGA0065444화ASGA0065455위우14호염색체상99 627 980화100 078 535 bp처.본연구위저적수육량성상제공료현저관련SNP위점,예측료신적후선기인.초보천석료중외저충수육량성상거대차이적분자궤제,위진일보개전분자육충공작제공료기출연구자료.