CAJ | 학술논문

凝血酶适体DNA[thrombin binding DNA aptamer d(G1 G2 T3 T4 G5 G6 T7 G8 T9 G10 G11T12T13G14G15),TBA]是对凝血酶有极高亲和性、并能有效抑制凝血酶凝血功能的单链DNA适体.凝血酶适体DNA在K+等离子存在时呈现出椅式构象,其中2个堆积的四碱基体(G-quartet)构成椅子的主体部分,而1个TGT loop环和2个TT loop环分别构成椅子的靠背和椅脚.我们测定了在K+存在时凝血酶适体DNA中亚氨基质子的交换速率,发现位于TGTloop环和TTloop环内的亚氨基质子G6、G5和G14由于受TGTloop环和TTloop环的保护有比较小的交换速率,而位于环之外的亚氨基质子G2、G11和G15有较大的交换速率;TGTloop环稳定性同TT loop环相似;碱基T4、T13和T9在稳定凝血酶适体DNA结构中起着很大的作用.这些证据进一步支持了凝血酶适体DNA的去折叠机制:位于TGT loop环和TTloop环之外的碱基对G1-G15、G2-G14和G5-G11首先断裂其Hoogsteen氢键,而TGT loop环、TT loop环和其内的Hoogsteen氢键保持完好;当温度进一步升高时,TGT loop环和两个TT loop环打开环状结构,凝血酶适体DNA的椅式构象彻底解体,转变为自由单链.
응혈매괄체DNA[thrombin binding DNA aptamer d(G1 G2 T3 T4 G5 G6 T7 G8 T9 G10 G11T12T13G14G15),TBA]시대응혈매유겁고친화성、병능유효억제응혈매응혈공능적단련DNA괄체.응혈매괄체DNA재K+등리자존재시정현출의식구상,기중2개퇴적적사감기체(G-quartet)구성의자적주체부분,이1개TGT loop배화2개TT loop배분별구성의자적고배화의각.아문측정료재K+존재시응혈매괄체DNA중아안기질자적교환속솔,발현위우TGTloop배화TTloop배내적아안기질자G6、G5화G14유우수TGTloop배화TTloop배적보호유비교소적교환속솔,이위우배지외적아안기질자G2、G11화G15유교대적교환속솔;TGTloop배은정성동TT loop배상사;감기T4、T13화T9재은정응혈매괄체DNA결구중기착흔대적작용.저사증거진일보지지료응혈매괄체DNA적거절첩궤제:위우TGT loop배화TTloop배지외적감기대G1-G15、G2-G14화G5-G11수선단렬기Hoogsteen경건,이TGT loop배、TT loop배화기내적Hoogsteen경건보지완호;당온도진일보승고시,TGT loop배화량개TT loop배타개배상결구,응혈매괄체DNA적의식구상철저해체,전변위자유단련.