中山大学学报(自然科学版)
中山大學學報(自然科學版)
중산대학학보(자연과학판)
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2012年
5期
100-106,136
,共8页
杨慧荣%赵会宏%蒙子宁%刘丽%林权卓
楊慧榮%趙會宏%矇子寧%劉麗%林權卓
양혜영%조회굉%몽자저%류려%림권탁
赤眼鳟%线粒体%D-loop%Cyt b%遗传变异%对比分析
赤眼鱒%線粒體%D-loop%Cyt b%遺傳變異%對比分析
적안준%선립체%D-loop%Cyt b%유전변이%대비분석
研究了长江和珠江野生赤眼鳟Squaliobarbus curriculus共4个群体24个个体的线粒体控制区(D-loop)和细胞色素b (Cyt b)基因序列,通过PCR扩增与测序,分别获得了长度为598 bp和752 bp的D-loop和Cyt b基因片段.分析表明,D-loop序列共定义了18个单倍型,存在34个简约信息位点,67个多态性位点,发生转换40次,颠换15次,插入/缺失14次.A、T、C、G平均含量分别为33.7%、35.1%、17.5%、13.7%.Cyt b序列共定义了18个单倍型,存在68个简约信息位点,72个多态性位点,发生转换60次,颠换15次,无插入/缺失位点.A、T、C、G平均含量分别为29.3%、26.4%、29.8%、14.5%.Cyt b除简约信息位点百分比大于D-loop外,多态位点百分比和单突变位点百分比均小于D-loop,说明D-loop具有较快的进化速率.D-loop序列的单倍型多样性(H)、平均核苷酸差异数(K)、核苷酸多样性(π)分别0.963 8、16.543 5和0.028 4,Cyt b的H、K和π分别为0.971 0、31.855 1和0.042 6,显示赤眼鳟具有较高的遗传多样性水平,且遗传变异主要存在于群体间.分析群体间的遗传距离和FST值,D-loop和Cyt b都一致表明:长江和珠江水系间存在明显的遗传分化,系统树和分子变异等级分析(AMOVA)也支持这一观点.同一水系群体间的遗传差异较小,Cyt b则更小;不同水系群体间的遗传差异较大,Cyt b则更大.故,Cyt b呈现出“小则越小,大则越大”的态势.分析其原因,可能与D-loop和Cyt b进化速率密切相关.
研究瞭長江和珠江野生赤眼鱒Squaliobarbus curriculus共4箇群體24箇箇體的線粒體控製區(D-loop)和細胞色素b (Cyt b)基因序列,通過PCR擴增與測序,分彆穫得瞭長度為598 bp和752 bp的D-loop和Cyt b基因片段.分析錶明,D-loop序列共定義瞭18箇單倍型,存在34箇簡約信息位點,67箇多態性位點,髮生轉換40次,顛換15次,插入/缺失14次.A、T、C、G平均含量分彆為33.7%、35.1%、17.5%、13.7%.Cyt b序列共定義瞭18箇單倍型,存在68箇簡約信息位點,72箇多態性位點,髮生轉換60次,顛換15次,無插入/缺失位點.A、T、C、G平均含量分彆為29.3%、26.4%、29.8%、14.5%.Cyt b除簡約信息位點百分比大于D-loop外,多態位點百分比和單突變位點百分比均小于D-loop,說明D-loop具有較快的進化速率.D-loop序列的單倍型多樣性(H)、平均覈苷痠差異數(K)、覈苷痠多樣性(π)分彆0.963 8、16.543 5和0.028 4,Cyt b的H、K和π分彆為0.971 0、31.855 1和0.042 6,顯示赤眼鱒具有較高的遺傳多樣性水平,且遺傳變異主要存在于群體間.分析群體間的遺傳距離和FST值,D-loop和Cyt b都一緻錶明:長江和珠江水繫間存在明顯的遺傳分化,繫統樹和分子變異等級分析(AMOVA)也支持這一觀點.同一水繫群體間的遺傳差異較小,Cyt b則更小;不同水繫群體間的遺傳差異較大,Cyt b則更大.故,Cyt b呈現齣“小則越小,大則越大”的態勢.分析其原因,可能與D-loop和Cyt b進化速率密切相關.
연구료장강화주강야생적안준Squaliobarbus curriculus공4개군체24개개체적선립체공제구(D-loop)화세포색소b (Cyt b)기인서렬,통과PCR확증여측서,분별획득료장도위598 bp화752 bp적D-loop화Cyt b기인편단.분석표명,D-loop서렬공정의료18개단배형,존재34개간약신식위점,67개다태성위점,발생전환40차,전환15차,삽입/결실14차.A、T、C、G평균함량분별위33.7%、35.1%、17.5%、13.7%.Cyt b서렬공정의료18개단배형,존재68개간약신식위점,72개다태성위점,발생전환60차,전환15차,무삽입/결실위점.A、T、C、G평균함량분별위29.3%、26.4%、29.8%、14.5%.Cyt b제간약신식위점백분비대우D-loop외,다태위점백분비화단돌변위점백분비균소우D-loop,설명D-loop구유교쾌적진화속솔.D-loop서렬적단배형다양성(H)、평균핵감산차이수(K)、핵감산다양성(π)분별0.963 8、16.543 5화0.028 4,Cyt b적H、K화π분별위0.971 0、31.855 1화0.042 6,현시적안준구유교고적유전다양성수평,차유전변이주요존재우군체간.분석군체간적유전거리화FST치,D-loop화Cyt b도일치표명:장강화주강수계간존재명현적유전분화,계통수화분자변이등급분석(AMOVA)야지지저일관점.동일수계군체간적유전차이교소,Cyt b칙경소;불동수계군체간적유전차이교대,Cyt b칙경대.고,Cyt b정현출“소칙월소,대칙월대”적태세.분석기원인,가능여D-loop화Cyt b진화속솔밀절상관.