免疫学杂志
免疫學雜誌
면역학잡지
IMMUNOLOGICAL JOURNAL
2005年
6期
514-517
,共4页
支轶%吴玉章%万瑛%邹丽云%郭晟%刘娜
支軼%吳玉章%萬瑛%鄒麗雲%郭晟%劉娜
지질%오옥장%만영%추려운%곽성%류나
MHCⅠ类分子%CTL%表位%分子对接%分子动力学
MHCⅠ類分子%CTL%錶位%分子對接%分子動力學
MHCⅠ류분자%CTL%표위%분자대접%분자동역학
目的通过分子对接方法筛选表位改造后的高亲和力CTL表位.方法在图形工作站上,将癌胚抗原来源的低亲和力表位及其N末端第一位残基以酪氨酸替换后的突变体,分别与MHC Ⅰ类分子进行对接,对接所得最佳构象进行600 ps分子动力学模拟修正.结果改造后的突变体与MHC分子间存在较强的氢键和疏水相互作用,组成肽结合槽口袋A的基Tyr7、Tyr171和Tyr159与多肽N末端形成稳定的氢键作用网络,并且P1位酪氨酸上的苯环可与Trp167上的苯环发生π-π堆积作用.结论分子对接模型预测的肽-MHC复合物作用模式,提示改造后的突变体与MHC Ⅰ类分子间具有更高的亲和力,与实验结果一致.
目的通過分子對接方法篩選錶位改造後的高親和力CTL錶位.方法在圖形工作站上,將癌胚抗原來源的低親和力錶位及其N末耑第一位殘基以酪氨痠替換後的突變體,分彆與MHC Ⅰ類分子進行對接,對接所得最佳構象進行600 ps分子動力學模擬脩正.結果改造後的突變體與MHC分子間存在較彊的氫鍵和疏水相互作用,組成肽結閤槽口袋A的基Tyr7、Tyr171和Tyr159與多肽N末耑形成穩定的氫鍵作用網絡,併且P1位酪氨痠上的苯環可與Trp167上的苯環髮生π-π堆積作用.結論分子對接模型預測的肽-MHC複閤物作用模式,提示改造後的突變體與MHC Ⅰ類分子間具有更高的親和力,與實驗結果一緻.
목적통과분자대접방법사선표위개조후적고친화력CTL표위.방법재도형공작참상,장암배항원래원적저친화력표위급기N말단제일위잔기이락안산체환후적돌변체,분별여MHC Ⅰ류분자진행대접,대접소득최가구상진행600 ps분자동역학모의수정.결과개조후적돌변체여MHC분자간존재교강적경건화소수상호작용,조성태결합조구대A적기Tyr7、Tyr171화Tyr159여다태N말단형성은정적경건작용망락,병차P1위락안산상적분배가여Trp167상적분배발생π-π퇴적작용.결론분자대접모형예측적태-MHC복합물작용모식,제시개조후적돌변체여MHC Ⅰ류분자간구유경고적친화력,여실험결과일치.
