生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
2期
165-170,174
,共7页
柯涛%毛晗%惠丰立%董彩华%柴国华%刘胜毅
柯濤%毛晗%惠豐立%董綵華%柴國華%劉勝毅
가도%모함%혜봉립%동채화%시국화%류성의
油料作物%油脂代谢%EST序列资源%生物信息学%代谢网络
油料作物%油脂代謝%EST序列資源%生物信息學%代謝網絡
유료작물%유지대사%EST서렬자원%생물신식학%대사망락
利用生物信息学方法,收集整理GenBank数据库中截至2008年5月收录的油料作物油菜、花生、芝麻、大豆、向日葵、蓖麻、亚麻、棕榈等八种油料作物的表达序列标签(EST)序列信息,共获得1,185,911条EST 序列,使用Crosmatch、RepeatMasker、Phrap、CAP3、EMBOSS、Blast、EST-pipeline、ORF finder、Interproscan、blast2go、IdentiCS等软件,基于Linux 操作系统,进行了综合及分类分析.共获得289,892条UniEST序列,通过以上对EST序列信息的基因注释信息,筛选出与油脂代谢相关的基因信息,并以此为基础构建了油料作物油脂代谢途径比较结构图.本研究为油料作物油脂代谢相关基因数据库的构建和不同油料作物油脂代谢异同的比较打下基础.
利用生物信息學方法,收集整理GenBank數據庫中截至2008年5月收錄的油料作物油菜、花生、芝痳、大豆、嚮日葵、蓖痳、亞痳、棕櫚等八種油料作物的錶達序列標籤(EST)序列信息,共穫得1,185,911條EST 序列,使用Crosmatch、RepeatMasker、Phrap、CAP3、EMBOSS、Blast、EST-pipeline、ORF finder、Interproscan、blast2go、IdentiCS等軟件,基于Linux 操作繫統,進行瞭綜閤及分類分析.共穫得289,892條UniEST序列,通過以上對EST序列信息的基因註釋信息,篩選齣與油脂代謝相關的基因信息,併以此為基礎構建瞭油料作物油脂代謝途徑比較結構圖.本研究為油料作物油脂代謝相關基因數據庫的構建和不同油料作物油脂代謝異同的比較打下基礎.
이용생물신식학방법,수집정리GenBank수거고중절지2008년5월수록적유료작물유채、화생、지마、대두、향일규、비마、아마、종려등팔충유료작물적표체서렬표첨(EST)서렬신식,공획득1,185,911조EST 서렬,사용Crosmatch、RepeatMasker、Phrap、CAP3、EMBOSS、Blast、EST-pipeline、ORF finder、Interproscan、blast2go、IdentiCS등연건,기우Linux 조작계통,진행료종합급분류분석.공획득289,892조UniEST서렬,통과이상대EST서렬신식적기인주석신식,사선출여유지대사상관적기인신식,병이차위기출구건료유료작물유지대사도경비교결구도.본연구위유료작물유지대사상관기인수거고적구건화불동유료작물유지대사이동적비교타하기출.
