甘肃农业大学学报
甘肅農業大學學報
감숙농업대학학보
JOURNAL OF GANSU AGRICULTURAL UNIVERSITY
2012年
4期
14-20
,共7页
曹健%罗玉柱%胡江%刘秀%李少斌%吴应童
曹健%囉玉柱%鬍江%劉秀%李少斌%吳應童
조건%라옥주%호강%류수%리소빈%오응동
甘南牦牛%H-FABP基因%多态性%生物信息学
甘南牦牛%H-FABP基因%多態性%生物信息學
감남모우%H-FABP기인%다태성%생물신식학
应用PCR产物混合样本DNA池法检测甘南牦牛心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因CDS区多态性,并应用生物信息学方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白质特性.结果表明:甘南牦牛H-FABP基因CDS区序列与九龙牦牛相同,而与普通牛对比在第3外显子存在* 76G>A的同义突变;甘南牦牛H-FABP氨基酸序列没有明显的疏水性区域,也未形成跨膜螺旋区及信号肽,推测其主要在细胞质中发挥生物学作用;甘南牦牛H-FABP基因编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主的mixed型;氨基酸序列与普通牛、山羊、马、人、小鼠、大鼠、鸡、草雀及绿鸭9个物种间同源性较高,与其实际亲缘关系远近一致.
應用PCR產物混閤樣本DNA池法檢測甘南牦牛心髒型脂肪痠結閤蛋白(H-FABP)基因CDS區多態性,併應用生物信息學方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白質特性.結果錶明:甘南牦牛H-FABP基因CDS區序列與九龍牦牛相同,而與普通牛對比在第3外顯子存在* 76G>A的同義突變;甘南牦牛H-FABP氨基痠序列沒有明顯的疏水性區域,也未形成跨膜螺鏇區及信號肽,推測其主要在細胞質中髮揮生物學作用;甘南牦牛H-FABP基因編碼產物二級結構是以α-螺鏇和β-摺疊為主的mixed型;氨基痠序列與普通牛、山羊、馬、人、小鼠、大鼠、鷄、草雀及綠鴨9箇物種間同源性較高,與其實際親緣關繫遠近一緻.
응용PCR산물혼합양본DNA지법검측감남모우심장형지방산결합단백(H-FABP)기인CDS구다태성,병응용생물신식학방법분석감남모우H-FABP단백질특성.결과표명:감남모우H-FABP기인CDS구서렬여구룡모우상동,이여보통우대비재제3외현자존재* 76G>A적동의돌변;감남모우H-FABP안기산서렬몰유명현적소수성구역,야미형성과막라선구급신호태,추측기주요재세포질중발휘생물학작용;감남모우H-FABP기인편마산물이급결구시이α-라선화β-절첩위주적mixed형;안기산서렬여보통우、산양、마、인、소서、대서、계、초작급록압9개물충간동원성교고,여기실제친연관계원근일치.