玉米科学
玉米科學
옥미과학
JOURNAL OF MAIZE SCIENCES
2012年
2期
64-68
,共5页
张体付%葛敏%韦玉才%赵涵
張體付%葛敏%韋玉纔%趙涵
장체부%갈민%위옥재%조함
玉米%InDel%分子标记%杂交种%纯度鉴定
玉米%InDel%分子標記%雜交種%純度鑒定
옥미%InDel%분자표기%잡교충%순도감정
InDel作为重要的遗传标记已被广泛用于作物连锁图谱的构建及多样性研究.通过生物信息学方法从玉米全基因组水平进行InDel标记的挖掘并对其在玉米杂交种纯度鉴定中的应用进行分析,根据B73全基因组序列(第二版)及Mo17的二代电子拼接序列发现了40 000多个InDel位点,其中约有11 400个含有InDel位点的序列可用于特异性引物的开发.新发展的143个代表基因(＜1 kb)或基因内部的功能性InDel标记在B73及Mo17间得到了验证并用于玉米杂交种纯度的鉴定.经过分析,共有13个共显性InDel标记在6个杂交种亲本间表现出明显的长度多态(＞50 bp).结合玉米子粒DNA快速提取方法,利用这些共显性InDel标记对6个杂交种1400多个样本纯度进行鉴定,结果显示该方法可以快速、准确、经济地鉴定玉米杂交种纯度.
InDel作為重要的遺傳標記已被廣汎用于作物連鎖圖譜的構建及多樣性研究.通過生物信息學方法從玉米全基因組水平進行InDel標記的挖掘併對其在玉米雜交種純度鑒定中的應用進行分析,根據B73全基因組序列(第二版)及Mo17的二代電子拼接序列髮現瞭40 000多箇InDel位點,其中約有11 400箇含有InDel位點的序列可用于特異性引物的開髮.新髮展的143箇代錶基因(＜1 kb)或基因內部的功能性InDel標記在B73及Mo17間得到瞭驗證併用于玉米雜交種純度的鑒定.經過分析,共有13箇共顯性InDel標記在6箇雜交種親本間錶現齣明顯的長度多態(＞50 bp).結閤玉米子粒DNA快速提取方法,利用這些共顯性InDel標記對6箇雜交種1400多箇樣本純度進行鑒定,結果顯示該方法可以快速、準確、經濟地鑒定玉米雜交種純度.
InDel작위중요적유전표기이피엄범용우작물련쇄도보적구건급다양성연구.통과생물신식학방법종옥미전기인조수평진행InDel표기적알굴병대기재옥미잡교충순도감정중적응용진행분석,근거B73전기인조서렬(제이판)급Mo17적이대전자병접서렬발현료40 000다개InDel위점,기중약유11 400개함유InDel위점적서렬가용우특이성인물적개발.신발전적143개대표기인(＜1 kb)혹기인내부적공능성InDel표기재B73급Mo17간득도료험증병용우옥미잡교충순도적감정.경과분석,공유13개공현성InDel표기재6개잡교충친본간표현출명현적장도다태(＞50 bp).결합옥미자립DNA쾌속제취방법,이용저사공현성InDel표기대6개잡교충1400다개양본순도진행감정,결과현시해방법가이쾌속、준학、경제지감정옥미잡교충순도.
