上海师范大学学报（自然科学版）
上海師範大學學報（自然科學版）
상해사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI TEACHERS UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES)
2005年
2期
66-71
,共6页
SARS冠状病毒%3′非翻译区%信息量%起始结合位点
SARS冠狀病毒%3′非翻譯區%信息量%起始結閤位點
SARS관상병독%3′비번역구%신식량%기시결합위점
严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)传染性强,死亡率高,给全世界约30个国家造成了巨大损失.其病原体为SARS冠状病毒(Severe acute Respiratory Syndrome Associated Coronavirus,SARS-CoV),是冠状病毒(Coronavirus)的新变异种.作者以"最大信息量"理论和方法为基础,使用结合位点搜寻软件等生物信息学方法,对冠状病毒基因组的3′非翻译区(Untranslated Regions,UTRs)进行分析,预测出了2株SARS-CoV(来自北京的SARSBJ01和浙江的SARSZJ01)以及其他38株冠状病毒株的复制酶起始结合位点(Replicase initial binding sites,RIBS).在该预测结果中,不难发现,这些RIBS的序列与前人的研究成果有很大的相似之处,与公认的冠状病毒的顺式作用元件极为相似的基序也存在其中,而且其预测的二级结构与鼠肝炎病毒MHV基因组的某些蛋白结合位点类似.因此,预测的RIBS在病毒的复制中可能起重要作用.
嚴重急性呼吸綜閤徵(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)傳染性彊,死亡率高,給全世界約30箇國傢造成瞭巨大損失.其病原體為SARS冠狀病毒(Severe acute Respiratory Syndrome Associated Coronavirus,SARS-CoV),是冠狀病毒(Coronavirus)的新變異種.作者以"最大信息量"理論和方法為基礎,使用結閤位點搜尋軟件等生物信息學方法,對冠狀病毒基因組的3′非翻譯區(Untranslated Regions,UTRs)進行分析,預測齣瞭2株SARS-CoV(來自北京的SARSBJ01和浙江的SARSZJ01)以及其他38株冠狀病毒株的複製酶起始結閤位點(Replicase initial binding sites,RIBS).在該預測結果中,不難髮現,這些RIBS的序列與前人的研究成果有很大的相似之處,與公認的冠狀病毒的順式作用元件極為相似的基序也存在其中,而且其預測的二級結構與鼠肝炎病毒MHV基因組的某些蛋白結閤位點類似.因此,預測的RIBS在病毒的複製中可能起重要作用.
엄중급성호흡종합정(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)전염성강,사망솔고,급전세계약30개국가조성료거대손실.기병원체위SARS관상병독(Severe acute Respiratory Syndrome Associated Coronavirus,SARS-CoV),시관상병독(Coronavirus)적신변이충.작자이"최대신식량"이론화방법위기출,사용결합위점수심연건등생물신식학방법,대관상병독기인조적3′비번역구(Untranslated Regions,UTRs)진행분석,예측출료2주SARS-CoV(래자북경적SARSBJ01화절강적SARSZJ01)이급기타38주관상병독주적복제매기시결합위점(Replicase initial binding sites,RIBS).재해예측결과중,불난발현,저사RIBS적서렬여전인적연구성과유흔대적상사지처,여공인적관상병독적순식작용원건겁위상사적기서야존재기중,이차기예측적이급결구여서간염병독MHV기인조적모사단백결합위점유사.인차,예측적RIBS재병독적복제중가능기중요작용.
