分析化学
分析化學
분석화학
CHINESE JOURNAL OF ANALYTICAL CHEMISTRY
2010年
2期
286-292
,共7页
徐长明%张纪阳%刘辉%孙汉昌%朱云平%谢红卫
徐長明%張紀暘%劉輝%孫漢昌%硃雲平%謝紅衛
서장명%장기양%류휘%손한창%주운평%사홍위
生物质谱%蛋白质组学%肽段可检测性%机器学习%评述
生物質譜%蛋白質組學%肽段可檢測性%機器學習%評述
생물질보%단백질조학%태단가검측성%궤기학습%평술
Biological mass spectrometry%Proteomics%Peptide detectability%Machine learning%Review
生物质谱是蛋白质组研究中的核心技术之一,可以实现大规模、高通量的蛋白质定性和定量分析.由于样品和实验过程自身的复杂性,质谱实验的重复性还存在一些问题,肽段鉴定和定量结果有很大的随机性,肽段的质谱检测概率问题在蛋白质组研究中,特别是定量蛋白质组研究中备受关注.本文总结了影响肽段可检测性的重要因素,分析了已经提出的计算预测方法,并对其在实验研究中的应用进行了综述.
生物質譜是蛋白質組研究中的覈心技術之一,可以實現大規模、高通量的蛋白質定性和定量分析.由于樣品和實驗過程自身的複雜性,質譜實驗的重複性還存在一些問題,肽段鑒定和定量結果有很大的隨機性,肽段的質譜檢測概率問題在蛋白質組研究中,特彆是定量蛋白質組研究中備受關註.本文總結瞭影響肽段可檢測性的重要因素,分析瞭已經提齣的計算預測方法,併對其在實驗研究中的應用進行瞭綜述.
생물질보시단백질조연구중적핵심기술지일,가이실현대규모、고통량적단백질정성화정량분석.유우양품화실험과정자신적복잡성,질보실험적중복성환존재일사문제,태단감정화정량결과유흔대적수궤성,태단적질보검측개솔문제재단백질조연구중,특별시정량단백질조연구중비수관주.본문총결료영향태단가검측성적중요인소,분석료이경제출적계산예측방법,병대기재실험연구중적응용진행료종술.
As the complexity of samples and experimental processes, the repeatability of mass spectrometry experiments is still not satisfactory, the results of peptide identification and quantification show high randomicity), the probability of peptide being detected by mass spectrometry in proteome research, especially in quantitative proteomic study, has received much attention. Therefore, a lot of experimental researches have been done, as well as a number of computational prediction methods have been developed. In this article, we summarized the important factors impacting the peptide detectability, investigated the existing prediction methods) and reviewed their applications in experimental study.